2. Lý sinh học là môn học nghiên cứu các hiện
tượng xảy ra trong các tổ chức và cơ thể
sống dựa trên quan điểm và các định luật
vật lý, từ mức độ điện tử, nguyên tử đến
toàn cơ thể
3. NHIỆM VỤ CỦA MÔN LÝ SINH
Nghiên cứu những quy luật vật lý xảy ra
và chi phối các quá trình sống
Ảnh hưởng của những tác nhân Vật lý lên
sự sống
Ứng dụng những kết quả nghiên cứu Lý –
Sinh vào Sinh – Nông – Y học
4. CHƯƠNG TRÌNH HỌC
CHƯƠNG 2. PHÂN TỬ VÀ DUNG DỊCH TRONG
CƠ THỂ SINH VẬT
CHƯƠNG 1. NHIỆT ĐỘNG HỌC CỦA CƠ THỂ SỐNG
CHƯƠNG 3. SỰ VẬN CHUYỂN VẬT CHẤT
TRONG CƠ THỂ SỐNG
CHƯƠNG 4. CÁC HIỆN TƯỢNG ĐIỆN
TRÊN CƠ THỂ SỐNG
CHƯƠNG 5. SINH HỌC PHÓNG XẠ
THỰC TẬP
LÝ THUYẾT
6. Nhiệt động học (Thermodynamics):
► Là môn học nghiên cứu sự chuyển hóa nhiệt
lượng sang các dạng năng lượng khác và
ngược lại.
► Dựa trên các thông số nhiệt động có thể:
+ Xác định hệ nhiệt động đang ở trạng thái nào
(đang biến đổi, cân bằng nhiệt động, cân bằng
dừng . . .)
+ Biết được khả năng xảy ra của một quá trình
nào đó trong hệ nhiệt động cũng như chiều
hướng và giới hạn của nó.
Tuy nhiên các thông số này không cho biết
được bản chất hoặc cơ chế của quá trình
7. Hệ nhiệt động:
Tập hợp số lượng lớn những phần tử vật chất, vật
thể … được giới hạn trong 1 không gian nhất định (cách
biệt với môi trường chung quanh).
Có 3 loại hệ nhiệt động:
Hệ biệt lập (Isolated Systems )
Hệ đóng (Closed Systems)
Hệ mở (Open Systems )
14. Sinh vật = vật sống, vật có sự sống
Sự sống theo Mednhicov: “ sự duy trì và tự tái tạo một cách tích cực
các cấu trúc đặc thù kèm theo tiêu tốn năng lượng”
Các tính chất đặc trưng của sự sống
Có cấu trúc phức tạp và tổ chức tinh vi: cơ thể sinh vật cũng được tạo
nên từ các nguyên tố hóa học trong tự nhiên nhưng cấu trúc bên trong vô
cùng phức tạp bao gồm vô số các hợp chất hóa học.
Có sự chuyển hóa năng lượng phức tạp: thu nhận năng lượng từ môi
trường ngoài và biến đổi nó để xây dựng và duy trì tổ chức phức tạp đặc
trưng cho sự sống.
Thông tin của sự sống thì ổn định, chính xác và liên tục: liên quan đến
các quá trình sống chủ yếu như sinh sản, phát triển, tiến hóa và các phản
ứng thích nghi.
16. Thông số trạng thái của hệ
► Là đại lượng đặc trưng cho trạng thái (của 1 hệ
nhiệt động)
► VD: Hệ khí có các thông số trạng thái:
+ N: số ptử + V: thể tích + U: Nội năng
+ P: áp suất + T: Nhiệt độ + S: entropy
► Tb sống có thông số trạng thái như:
+ Nồng độ chất (C) + Nồng độ ion + độ pH
+ áp suất thẩm thấu
17. Thông số trạng thái
Trạng thái Cân bằng Quá trình Cân bằng
Trạng thái của hệ có các
thông số ko đổi theo time
=> Đạo hàm các thông số
trạng thái của hệ = 0
Gồm 1 chuỗi liên tiếp các
trạng thái cân bằng
=> Quá trình thuận nghịch
►VD: Các quá trình dãn nở khí, đẳng áp,
đẳng nhiệt lý tưởng
18. Thông số quá trình
Nhiệt lượng Q
Công cơ họcA
Quy ước về dấu với công và nhiệt:
Trong nhiệt động:
A>0 hệ sinh công, Q>0 hệ thu nhiệt
Trong nhiệt hóa thì ký hiệu nhiệt lượng q
q>0 hệ tỏa nhiệt, q<0 hệ thu nhiệt.
19. Cân bằng nhiệt động:
Là trạng thái mà hệ không có bất kỳ sự biến
đổi nào và các thông số trạng thái không biến
đổi theo thời gian.
Khi ở trạng thái cân bằng nhiệt động thì hệ
không còn khả năng sinh công.
20. Một số quá trình nhiệt động
Quá trình biến đổi trạng thái
Phương trình Mendeleev-Clapeyron
pV = nRT
R – 8.31 J/mol.K 0 hằng số khí lý tưởng
A – đẳng áp
Entanpi: H = U + pV
dH = dU + d(pV)
B – đẳng tích
C – đẳng nhiệt
21. Năng lượng
Đặc trưng cho khả năng sinh công của vật.
“Thước đo” cho sự chuyển vận của vật chất
>>> là khả năng làm thay đổi trạng thái /
thực hiện công năng lên một hệ vật chất.
Đơn vị: Jun, Calo, kW.h, eV … kg.m2.s-2
Năng lượng trong trọng trường gồm: Động
năng, Thế năng, Nội năng
22. Nội năng
Năng lượng dự trữ toàn phần của tất cả các dạng
chuyển động và tương tác của tất cả các phần từ nằm
trong hệ.
Gồm:
+ năng lượng chuyển động tịnh tiến của phân tử
+ năng lượng e- trong ngtu
+ năng lượng hạt nhân của phân từ
+ năng lượng dao động, quay của các phân tử
+ năng lượng liên kết bề mặt ở giữa các pha …
Ngoại trừ: Động năng của chuyển động tập thể của hệ và thế
năng tương tác của hệ với môi trường bên ngoài ( trọng trường ).
U = 3/2nRT đối với khí lý tưởng
23. CÁC NGUYÊN LÝ NHIỆT ĐỘNG TRONG HỆ SỐNG
Phương pháp nghiên cứu – thống kê
Phương pháp nhiệt động
Nguyên lý số 0
nếu hai hệ cân bằng nhiệt với một
hệ thứ ba thì chúng ở trạng thái
cân bằng nhiệt với nhau
ứng dụng:
24. CÁC NGUYÊN LÝ NHIỆT ĐỘNG TRONG HỆ SỐNG
Định luật bảo toàn & biến đổi năng lượng: “Năng lượng
không tự nhiên xuất hiện và không thể biến mất, nó chỉ
biến đổi từ dạng này sang dạng khác”
Nguyên lý thứ nhất: “Nhiệt lượng Q mà hệ nhận được
trong một quá trình bất kỳ sẽ bằng công A mà hệ sinh
ra cộng với sự biến đổi nội năng U của hệ”
Q = A + U
►Q > 0 Khi hệ thu nhiệt
►Q < 0 Khi hệ mất nhiệt
25. ÁP DỤNG NGUYÊN LÝ THỨ NHẤT CHO HỆ THỐNG
SỐNG
4 dạng công cơ bản trong cơ thể sống:
Công hóa học: công sinh ra khi tổng hợp các
macromolecule
Công cơ học: công sinh ra khi dịch chuyển các bộ
phận của cơ thể
Công thẩm thấu: công vận chuyển các chất qua màng
(vận chuyển tích cực)
Công điện: công vận chuyển các hạt mang điện
Cần năng lượng ATP (nhiên liệu vạn năng của tế bào)
26. Những hạn chế của Định luật 1 NĐH
Cà phê ở lặng yên trong cốc trên bàn nó
tự nhiện lạnh xuống và tự xoay tròn?
Tại sao không thể cấp nhiệt để hòn đá
tự sinh công để nâng mình lên được?
Quá trứng rơi xuống cái cốc và vỡ, vậy
khi đun nóng quá trứng sao không trở
thành nguyên vẹn và tự nhảy lên?
Cái gì trên thế giới xác định chiều
hướng của thời gian, quá trình?
27. C6H12O6 + 6O2 6CO2+ 6H2O + 678 Kcal
La Voizier và Laplace (1780) đã làm thí nghiệm
như sau:
U Q
28. Kết quả cho thấy:
Q U
Sở dĩ như vậy là vì ta đã giả định A = 0
Trên những thiết bị hiện đại hơn Etoiter (1904)
đã thu được kết quả cho thấy sự sai lệch không
đáng kể giữa Q và U
29. Nguyên lý thứ hai cho biết khả năng cũng như
xu hướng của các quá trình trong hệ.
Đối với hệ sống, người ta xét trên 3 đại lượng:
- Gradien
- Entropy
- Năng lượng tự do
CÁC NGUYÊN LÝ NHIỆT ĐỘNG TRONG HỆ SỐNG
30. Gradien
Gradien – của 1 tham số nào đó là hiệu giá
trị của tham số đó ở 2 điểm chia cho khoảng
cách giữa hai điểm đó.
Exp: gradien nồng độ dC/dx = (C2-C1)/dx
Là 1 đại lượng vector
Gradien nồng độ, gradien điện thế … như vậy
sự có mặt của gradien tạo ra khả năng thực
hiện công của tế bào sống.
31. Gradien
►Đại lượng vật lý có trị số = độ biến thiên
của đại lượng trên 1 đơn vị dài
Gradien của nồng độ: Grad(C) = dC/dx
►Đặc trưng của tb sống là tb luôn tồn tại
nhiều loại gradien. Khi tb chết thì gradien
mất.
32. Gradien tế bào
► Gradien thẩm thấu:
Áp suất thẩm thấu chênh lệch (đặc biệt là giữa bên
trong & bên ngoài tb)
► Gradien màng
2 phía màng tb có sự phân bố giữa các chất ko đồng
đều
Màng tb có tính bán thấm:
+ Ptử nhỏ qua lại dễ dàng
+ Ptử lớn khó thấm, khó giải phóng ra khỏi tb
33. Gradien điện
►Gradien điện thế: 2 phía màng tb chênh
lệch ion Na+, K+ …
►Gradien điện hóa
- Bằng gradien nồng độ + graiden điện thế
- Các hạt mang điện trong & ngoài tb pbố ko
đều
35. Entropy
► Nguyên lý II nhiệt động học
► Ký hiệu: S
► Đặc trưng cho mức hỗn loạn, bất trật tự về phân
bố của hệ nhiệt động
Thước đo mức hỗn loạn về phân bố ptử của hệ
S tăng khi hệ nhiệt động biến đổi giữa các trạng thái
phân bố trật tự (càng hỗn loạn càng tăng)
36. Entrophy và NL II Nhiệt động
Entrophy là 1 khái niệm khá trừu tượng, nên để
dễ nắm bắt vấn đề, cần đưa ra 1 số quá trình
chính:
1/ Quá trình chuyển công thành nhiệt và
chuyển nhiệt thành công
2/ Quá trình thuận nghịch và bất thuận nghịch
3/ Chu trinh Carnot và động cơ nhiệt
37. 1/ Quá trình chuyển công thành nhiệt
& chuyển nhiệt thành công
Định luật 2 (dạng 1): Không thể biển đối nhiệt
lượng hoàn toàn thành công mà không có một sự
biến đổi nào khác xảy ra.
>> công có thể biến hoàn toàn thành nhiệt
nhưng nhiệt chỉ có thể biến một phần thành
công, còn một phần không thể tránh khỏi, bị mất
mát cho môi trường
Q>A
38. a) Quá trình thuận nghịch:
Là quá trình tự nó có thể trở về trạng thái ban
đầu mà không cần cung cấp năng lượng từ
bên ngoài.
2. QUÁ TRÌNH THUẬN NGHỊCH &
BẤT THUẬN NGHỊCH
39. b) Quá trình bất thuận nghịch
Là quá trình tự nó không có thể trở về
trạng thái ban đầu nếu không được cung
cấp năng lượng từ bên ngoài.
Mọi quá trình hóa sinh và lý sinh xảy ra
trong cơ thể sống đều là các quá trình bất
thuận nghịch
40. Quá trình bất thuận nghịch
► 1 quá trình biến đổi:
+ Chiều thuận xảy ra, chiều nghịch ko thể tự xảy ra
(hoặc ngược lại)
+ Mtrg xung quanh thay đổi do quá trình
Thì gọi là quá trình bất thuận nghịch (ko cân bằng)
VD: quá trình truyền nhiệt, biến đổi công thành
nhiệt
Thường các quá trình trong tự nhiên là bất thuận
nghịch)
41. 1. Quá trình thuận nghịch:
Là quá trình tự nó có thể trở về trạng thái ban
đầu mà không cần cung cấp năng lượng từ
bên ngoài.
QUÁ TRÌNH THUẬN NGHỊCH
VÀ BẤT THUẬN NGHỊCH
2. Quá trình bất thuận nghịch:
Là quá trình tự nó không có thể trở về
trạng thái ban đầu nếu không được cung cấp
năng lượng từ bên ngoài.
Mọi quá trình hóa sinh và lý sinh xảy ra trong
cơ thể sống đều là các quá trình bất thuận
nghịch
42. 3. Chu trình Carnot ( ~1820 )
1 chu trình thuận nghịch.
Thực nghiệm cũng đã chứng minh rằng mọi chu
trình nhiệt động lực học thuận nghịch đều là chu
trình kết hợp của các chu trình Carnot nhỏ hơn.
43. Chu trình Carnot
“Hiệu suất của tất cả các máy nhiệt hoạt động
theo chu trình Carnot thuận nghịch không phụ
thuộc vào cấu tạo máy mà chỉ phụ thuộc và
nhiệt độ nguồn nóng và nguồn lạnh”
η = A/Q = (T1 – T2)/T1
>>>>> η < 1
“Tất cả các chu trình không thuận nghịch có
hiệu suất nhỏ hơn các chu trình thuận nghịch
hoạt động giữa cùng hai nguồn nhiệt.”
44. 3. Động cơ nhiệt
Động cơ nhiệt là những động
cơ trong đó một phần năng
lượng của nhiên liệu bị đốt cháy
chuyển hóa thành cơ năng. Các
loại động cơ nhiệt: máy hơi
nước, động cơ đốt trong
Một động cơ nhiệt phải tiếp xúc
với 2 nguồn nhiệt: nguồn nóng
và nguồn lạnh.
45. Sự truyền nhiệt
Định luật 2 (dạng 2):
Nhiệt lượng không thể
truyền từ một vật này
sang một vật khác
nóng hơn mà không có
sự thay đổi nào khác
xảy ra.
Máy lạnh lý tưởng
không tồn tại
46. Entropy trong hệ nhiệt động chất lỏng
►Quá trình đông đặc đưa các ptử đến trạng
thái sắp xếp tại những vị trí xác định
►Lúc đó, Entropy giảm vì:
+ Hỗn loạn giảm
+ Tính trật tự tăng
+ Tỏa nhiệt
47. Nguyên lý tăng entropi trong sinh học
► KHÔNG đóng vai trò quyết định chiều hướng diễn
biến của quá trình sinh học
► Liên quan đến tính trật tự của hệ
► Thuyết tiến hóa Darwin: cơ thể động vật ngày
càng hoàn chỉnh về cấu trúc. Các quá trình sống
trong cơ thể phối hợp tốt hơn entropy giảm
48. Định nghĩa 1: Entropy - Nhiệt rút gọn
Q/T – nhiệt rút gọn
Tổng đại số nhiệt rút gọn trong chu trình
Carnot “thuận nghịch” bằng 0.
Entropy – hàm trạng thái, đặc trưng cho
trạng thái của hệ.
Quan tâm đến sự biến thiên entropy hơn là
giá trị tuyết đối của nó.
Sự biến thiên entropy trong quá trình thuận
nghịch có giá trị bằng tổng nhiệt rút gọn
49. Biến thiên Entropy trong quá trình
thuận nghịch
Ở quá trình thuận nghịch đẳng nhiệt
ΔS = S2 – S1 = dQ/T
Ở quá trình thuận nghịch đoạn nhiệt
ΔS = 0
50. Biến thiên Entropy trong quá trình
bất thuận nghịch
ΔS > 0
ΔS > ∫dQ/T
.
Entropy đặc trưng cho tính một chiều, tính
bất thuận nghịch của quá trình.
51. Định nghĩa 2: Entropy – mức độ
hỗn loạn của hệ
Entropy còn đặc trưng cho mức độ hỗn
loạn của hệ, “thước đo” độ bất trật tự
của hệ.
Xác suất nhiệt động ω: số các trạng thái
vi mô tương ứng với trạng thái vĩ mô
của hệ.
S = k lnω
53. Entropi là gì?
Entropi – mũi tên thời gian
Entropi – mức độ của sự hỗn độn nguyên tử
54. Năng lượng tự do
►Phần nội năng dùng để sinh công có ích
55. Các hàm nhiệt động
Entanpi và nội năng
H(S,p) = U + pV; dH = dU + d(pV)
U = U(S,V); dQ = dU + dA >> dU = TdS – d(pV)
Năng lượng tự do
F(T,V) = U – TS; dF = dU - TdS
Thế nhiệt động Gibbs – Entanpi tự do
G(T,p) = U – TS + pV; G = F + pV; G = H - TS
ΔG = ΔH - TΔS
56. Điều kiện tự diễn biến của hệ ( phản ứng )
Hệ tự phát thì dS> dQ/T
Với V = const
dU = dQ – PdV = dQv
dS> dU/T >>> dU – TdS < 0
Với P = const thì dQ = dH
dS > dH/T
Với P,T = const
dG = dH – TdS – SdT = dH – TdS >>> (dG)T,P <0
57. Ứng dụng nguyên lý II
Cho thấy khả năng, chiều hướng và giới
hạn của 1 quá trình: gradient.
Quá trình diễn ra làm tăng entropy của
hệ cho tới khi cân bằng: 1 quá trình tự
diễn là quá trình tự tiến tới sự hỗn loạn.
Hệ thống sống là hệ có cấu trúc trật tự
cao, vậy có áp dụng NL II được không?
58. Thay đổi Entropy ở hệ thống sống
Hệ thống sống: có trật tự cao và khả năng sinh
công, Entropi không cực đại và năng lượng tự
do không cực tiểu.
dSe gây bởi sự tương tác với môi trường xung
quanh
dSi gây bởi những thay đổi bên trong hệ
dS = dSe + dSi
Hệ cô lập dSe = 0 >> dS >0
Công thức Prigogine
dS/dt = dSe /dt + dSi /dt ( = 0 ở cân bằng dừng )
59. Trạng thái Cân bằng
nhiệt động
Trạng thái Cân bằng
dừng
Hệ kín / cô lập Hệ mở, có dòng vật chất, năng
lượng ra vào
Không tồn tại gradient Tồn tại các loại gradient
Tốc độ pu thuận = tốc độ pu
nghịch
Tốc độ pư thuận và pư nghich
khác nhau
F = 0, hệ không có khả năng
sinh công
F khác không và là 1 hăng số
(ΔF = 0), hệ có khẳ năng sinh
công
Entropy max Entropy khác không và là hăng
số
60. Vấn đề còn bỏ ngỏ
Quá trình tự diễn tiến nhưng diễn
ra như thế nào?
Có các quá trình khác nhau trong
hệ diễn ra song song, nối tiếp
hay có quan hệ phức tạp khác?
61. Tham khảo:
Lý Sinh học. Nguyễn Thị Kim Ngân
1999. Chương 1.
Lý sinh học. Phan Sỹ An, NXB Yhọc,
2005. Chương 1.
Cơ sở vật lý: tập 3 Nhiệt học. D.
Halliday. NXB Giáo dục 1998.
Giáo trình Nhiệt học. Nguyễn Huy Sinh.
NXB Giáo dục, 2009. Chương 2,
Chương 5.
Editor's Notes
VD:
1 thể tích nước trong bình
1 khối khí trong cylinder
1 cơ thể sinh vật, hoặc nhỏ hơn là 1 tb sống
Hệ nhiệt động cô lập: Nước trong phích kín, cách nhiệt tốt
Hệ nhiệt động kín: Chỉ trao đổi năng lượng, Ko trao đổi vật chất với bên ngoài
VD: nước trong phích kín nhưng cách nhiệt kém
VD: nước trong phích hở, cơ thể sống của sinh vật
Khi hệ thay đổi trạng thái:
Các thông số của hệ cx thay đổi theo những quy luật 1st định
Thông số cường độ P, C, ε, µ
Thông số khuyếch độ ( system size ): m, U, H, S, V, E
Gradien nồng độ hình thành:
Do chất hữu cơ & vô cơ của tb phân bố ko đồng đều
Entropi: Hàm trạng thái, phụ thuộc vào trạng thái của hệ
Tổng đại số nhiệt rút gọn trong chu trình carnot “thuận nghịch” = 0
Entropi thay đổi do các ptử trong hệ thay đổi chuyển động nhiệt, các ptử thay đổi sự tương tác
Tính trật tự trong hệ sv là kết quả của sự tiến hóa