Dr. Burak Hacıhanefioğlu 1969 yılında İstanbul’da doğdu. 1986 yılında girdiği Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesinden 1993 yılında mezun oldu.
1993-1999 yılları arasında İstanbul Üniversitesi Cerrahpaşa Tıp Fakültesi'nde Kadın Hastalıkları ve Doğum ihtisası yaptı.
Kadın Hastalıkları ve Doğum ihtisası döneminde ‘’Polikistik Ovaryum Sendromunda İnsülin Direnci ve Renin-Angiotensin sistemi (RAS) arasındaki ilişkinin değerlendirilmesi’’ konulu tezini tamamladı.
Dr. Burak Hacıhanefioğlu Kadın Hastalıkları ve Doğum ihtisasını bitirdikten sonra sonra 1999 yılında İsveç'te Orebro Üniversitesinde polikistik over sendromu’nda yumurt