La misión de la Coordinación es realizar investigación orientada a problemas generales de la hidráulica, colaborar con entidades públicas y privadas para mejorar la práctica de la ingenierÃa en el ámbito nacional, proporcionar servicios de ingenierÃa a los diversos sectores de la sociedad.
Asimismo, ha puesto especial atención en la formación de recursos humanos y en difundir los resultados de sus investigaciones, contribuyendo asà al desarrollo del paÃs y al bienestar de la sociedad.