Enzim dan koenzim
?Download as PPTX, PDF?
0 likes?5,271 views
This presentation describe about enzyme and coenzyme in basic of biochemistry point of view.
Enzim dan koenzim
- 1. ENZIM DAN KOENZIM Heru Pramono, S.Pi., M.Biotech
- 2. Outline 1. Konsep energi, nutrisi, reaksi biokimia 2. Energi aktivasi 3. Katalis 4. Protein dan enzim 5. Klasifikasi enzim dan mekanisme kerja enzim 6. Kofaktor/koenzim 7. Turn over number
- 3. 1. Konsep energi, nutrisi, dan reaksi biokimia ? Seluruh makhluk hidup butuh energi ? Nutrisi ? salah satu bahan biotis yang dibutuhkan sebagai sumber energi ? Konversi nutrisi menjadi energi disebut proses metabolisme nutrisi yang disebut katabolisme ? Katabolisme ? reaksi biokimia pemecahan senyawa nutrisi kompleks menjadi senyawa yang lebih sederhana dan melepaskan energi ? Bentuk penyimpanan energi ATP
- 4. 2. Energi aktivasi ? Diperkenalkan oleh Svante Arrhenius ? Definisi : Energi minimum yang dibutuhkan agar reaksi kimia tertentu dapat terjadi ? Dinyatakan dengan Ea
- 7. 3. Katalis ? Katalis merupakan suatu zat atau substansi yang dapat mempercepat reaksi (dan mengarahkan atau mengendalikannya), tanpa terkonsumsi oleh reaksi, namun bukannya tanpa bereaksi. ¨C Lowers the activation energy needed to start a reaction ¨C Is not used up during the reaction ¨C Is unchanged after a reaction
- 8. 4. Protein dan enzim ? Protein merupakan senyawa polimer asam amino ? Enzim merupakan biomolekul yang tersusun atas protein dan memiliki active site (situs/bagian aktif) ¨C Active site suatu enzim biasanya hanya bagian kecil dari enzim tersebut ¨C Biasanya dinamai dengan akhiran ¨Case misal : Protease ¨C Kerjanya SPESIFIK ¨C Terdapat pada seluruh makhluk hidup (atau setengah hidup) mulai virus hingga mamalia
- 9. Reaksi dengan dan tanpa enzim
- 10. 5. Klasifikasi Enzim dan mekanisme kerja enzim ? Enzim diklasifikasikan berdasarkan tipe dan mekanisme reaksi ? Awalnya hanya disebut berdasarkan pemecahan/hidrolisis senyama dengan ikatan kovalen ¨C Protease, lipase, amilase, dll ? Pada senyawa yang sama dapat terjadi reaksi selain hidrolisis, semisal reaksi oksidasi. Oleh karenanya saat ini penyebutan enzim berdasarkan pada tipe dan mekanisme reaksi
- 11. Sistem IUB ? International Union of Biochemistry memberi sistem penamaan enzim 1. Reaksi dan enzim yang mengatalisis enzim tersebut membentuk enam kelas, masing-masing mempunyai 4-13 sub kelas 2. Nama enzim terdiri atas dua bagian, nama pertama menunjukkan substrat dan nama kedua yang berakhiran ase menyatakan tipe reaksi yang dikatalisis 3. Informasi tambahan, bila diperlukan untuk menjelaskan reaksi dapat dituliskan dalam tanda kurung di bagian akhir 4. Enzim memiliki EC yang mencirikan tipe reaksi ke dalam reaksi (digit pertama), subkelas (digit kedua), subsubkelas (digit keempat)
- 12. Contoh penamaan enzim Alkohol dehidrogenase Substrat Reaksi
- 13. Based on EC 1. EC 1 Oksidoreduktase: mengatalisis reaksi oksidasi/reduksi 2. EC 2 Transferase: mentransfer gugus fungsi 3. EC 3 Hidrolase: mengatalisis hidrolisis berbagai ikatan 4. EC 4 Liase: memutuskan berbagai ikatan kimia selain melalui hidrolisis dan oksidasi 5. EC 5 Isomerase: mengatalisis isomerisasi sebuah molekul tunggal 6. EC 6 Ligase: menggabungkan dua molekul dengan ikatan kovalen
- 14. Mekanisme kerja? LOCK AND KEY Satpol PP makcomblang
- 15. 6. Koenzim ? Banyak enzim membutuhkan koenzim untuk aktif ? Tanpa koenzim enzim tersebut tak mampu menjadi katalisator yang efektif BERIKATAN KOVALEN GUGUS PROSTETIK TIDAK BERIKATAN KOVALEN SUBSTRAT SEKUNDER KOENZIM
- 17. Klasifikasi Koenzim ? Klasifikasi koenzim berdasarkan pada gugus yang pemindahannya dipermudah oleh koenzim tersebut ? Untuk pemindahan gugus bukan hidrogen ¨C Gula fosfat ¨C KoA-SH ¨C Biotin ? Untuk pemindahan hidrogen ¨C FAD ¨C NAD + , NADP+
- 18. 7. Turn over number ? Jumlah reaksi yang dapat dibantu oleh satu enzim dalam waktu tertentu (semisal satu menit) ? Semakin besar turn over number suatu enzim semakin cepat reaksi yang dikatalis ? Turn over number tergantung pada kondisi lingkungan terjadinya reaksi
- 19. 8. Kondisi lingkungan reaksi ? Kondisi lingkungan yang mempengaruhi reaksi ¨C Suhu ¨C pH ¨C Substrat ¨C Inhibitor
- 20. Suhu ? Enzim tersusun atas protein ? Protein dapat mengalami denaturasi pada suhu tertentu tergantung pada penyusun protein tersebut ? Semakin sedikit ikatan sulfida, semakin mudah untuk terjadinya denaturasi ? Setiap enzim memiliki rentang aktivitas yang spesifik terhadap suhu ¨C Taq Polymerase ? tetap kompak pada suhu 95 C ¨C Tripsin ? pada suhu 95 sudah terdenaturasi
- 22. pH ? pH berpengaruh pada konformasi tiga dimensi suatu enzim ? pH optimum enzim umumnya adalah netral (pH 7) namun beberapa enzim aktif pada pH asam/basa
- 23. Substrat/ Kompetisi enzim ? Terdapat dua jenis inhibisi ¨C Reversibel ¨C Irreversibel ? Reversibel ? enzim masih dapat aktif kembali setelah inhibitor lepas dari enzim ? Irreversibel ? terjadi ikatan yang mengubah aktivitas enzim untuk seterusnya
- 25. Jenis inhibisi reversibel ? Competitive inhibition ? Uncompetitive inhibition, ? Mixed inhibition ? Non-competitive inhibition