En tant qu’établissement public du ministère en charge du développement durable, l'agence de l'eau Rhin-Meuse a pour mission de contribuer à réduire les pollutions et protéger les ressources en eau et milieux naturels aquatiques de la Lorraine (Vosges et Meuse en partie), l’Alsace et d’une partie de la Champagne-Ardenne.