ݺߣ

ݺߣShare a Scribd company logo
Сергей Мастицкий
БГУ, Минск, май 2014
Ewan Birney, глава отдела «Nucleotide Data» в European
Bioinformatics Institute, EMBL
Из сообщения в его блоге “Five statistical things I wished I had been
taught 20 years ago”
 Методы непараметрической статистики
 R
 Проблема множественных сравнений
 Связь между Р-значением, размером
эффекта и объемом выборки
 Линейные модели и PCA
Author: Sergey Mastitsky
 Абсолютно бесплатно – особенно важно для
академических учреждений
 Язык, специально созданный для стат. анализа
 Огромные возможности для визуализации
данных
 Более 5000 пакетов-расширений
 Развивается быстрее любого коммерческого ПО
 Сотни книг, “The R Journal”, “Journal of Statistical
Software”
 Огромное число пользователей (>2 млн., 2012 г.)
= поддержка, быстрое исправление ошибок
Author: Sergey Mastitsky
 Работа из командной строки – не то, что
ожидают пользователи, привыкшие
«нажимать на кнопки»
 R – это язык (требует времени для изучения)
 Справочная информация зачастую написана
сухим техническим [английским] языком –
новички часто теряются и расстраиваются
Author: Sergey Mastitsky
 Книги – в основном издаются Springer,
Cambridge University Press и
Chapman & Hall
 Блоги – чрезвычайно ценный источник:
 r-bloggers.com
 r-analytics.blogspot.com
 Специальные курсы, в т.ч. онлайн:
 coursera.com (бесплатно/платно)
 statistics.com (платно)
Author: Sergey Mastitsky
 Основные принципы работы с R и RStudio
 Описательная статистика, основы R-графики,
классические статистические методы (t-тест,
ANOVA, корреляционный анализ)
 Простая и множественная регрессия
 В конце: вы получите все материалы курса,
включая примеры кода, пригодные для
повторного использования
Author: Sergey Mastitsky
 Я объясняю новые понятия и привожу
примеры – вы повторяете
 Я даю небольшие задания – вы
выполняете
Author: Sergey Mastitsky
Тема 1
Инсталляция R и RStudio
Author: Sergey Mastitsky
Author: Sergey Mastitsky
Author: Sergey Mastitsky
… потом следуйте инструкциям
Author: Sergey Mastitsky
Что выбрать:
- Если у вас есть права
Администратора: C:Program Files
- Если нет: любая директория,
которая вам нравится.
Author: Sergey Mastitsky
• Если система R установлена в C:Program Files,
пропустите этот шаг
• Иначе:
- Заходим в папку, где находится R, например:
C:UsersMastitSER-2.15.0
- Идем в C:UsersMastitSER-2.15.0etc и
открываем файл Rprofile.site в текстовом
редакторе (лучше всего Notepad)
Author: Sergey Mastitsky
Измените путь к папке (ее нужно сначала создать!), куда
вы хотели бы устанавливать все дополнительные пакеты,
например:
# set a site library
.Library.site <- "c:UsersMastitSEMyRlibs"
Командная строка:
здесь мы общаемся с R
Author: Sergey Mastitsky
• Интегрированная
среда разработки
(IDE) для R
• Сочетает
интуитивный
интерфейс с
мощными
средствами для
разработки кода R
Author: Sergey Mastitsky
Author: Sergey Mastitsky
Author: Sergey Mastitsky
Author: Sergey Mastitsky
Поступаем так же, как и
при установке R …
Консоль R: здесь мы
общаемся с R, вводя
команды
Редактор кода
Служебное окно 1
Author: Sergey Mastitsky
Служебное окно 2
 Зайдите на сайт R Project и ознакомьтесь с его
основными разделами
 Из раздела “Documentation/Manuals” загрузите
PDF-файлы “An Introduction to R” и “R Data
Import/Export” – настоятельно рекомендую к
изучению!
 Обратите внимание на раздел “Documentation”
Author: Sergey Mastitsky
 Зайдите на сайт r-analytics.blogspot.com
 Зайдите на страницу “Работа с RStudio” –
здесь вы можете подробнее узнать о работе с
этим инструментом и найти PDF-файл
руководства на русском языке
 Обратите внимание на разделы “Инсталляция
R” и “Библиотека”
Author: Sergey Mastitsky

More Related Content

Инсталляция системы статистических вычислений R

  • 2. Ewan Birney, глава отдела «Nucleotide Data» в European Bioinformatics Institute, EMBL Из сообщения в его блоге “Five statistical things I wished I had been taught 20 years ago”  Методы непараметрической статистики  R  Проблема множественных сравнений  Связь между Р-значением, размером эффекта и объемом выборки  Линейные модели и PCA Author: Sergey Mastitsky
  • 3.  Абсолютно бесплатно – особенно важно для академических учреждений  Язык, специально созданный для стат. анализа  Огромные возможности для визуализации данных  Более 5000 пакетов-расширений  Развивается быстрее любого коммерческого ПО  Сотни книг, “The R Journal”, “Journal of Statistical Software”  Огромное число пользователей (>2 млн., 2012 г.) = поддержка, быстрое исправление ошибок Author: Sergey Mastitsky
  • 4.  Работа из командной строки – не то, что ожидают пользователи, привыкшие «нажимать на кнопки»  R – это язык (требует времени для изучения)  Справочная информация зачастую написана сухим техническим [английским] языком – новички часто теряются и расстраиваются Author: Sergey Mastitsky
  • 5.  Книги – в основном издаются Springer, Cambridge University Press и Chapman & Hall  Блоги – чрезвычайно ценный источник:  r-bloggers.com  r-analytics.blogspot.com  Специальные курсы, в т.ч. онлайн:  coursera.com (бесплатно/платно)  statistics.com (платно) Author: Sergey Mastitsky
  • 6.  Основные принципы работы с R и RStudio  Описательная статистика, основы R-графики, классические статистические методы (t-тест, ANOVA, корреляционный анализ)  Простая и множественная регрессия  В конце: вы получите все материалы курса, включая примеры кода, пригодные для повторного использования Author: Sergey Mastitsky
  • 7.  Я объясняю новые понятия и привожу примеры – вы повторяете  Я даю небольшие задания – вы выполняете Author: Sergey Mastitsky
  • 12. … потом следуйте инструкциям Author: Sergey Mastitsky Что выбрать: - Если у вас есть права Администратора: C:Program Files - Если нет: любая директория, которая вам нравится.
  • 13. Author: Sergey Mastitsky • Если система R установлена в C:Program Files, пропустите этот шаг • Иначе: - Заходим в папку, где находится R, например: C:UsersMastitSER-2.15.0 - Идем в C:UsersMastitSER-2.15.0etc и открываем файл Rprofile.site в текстовом редакторе (лучше всего Notepad)
  • 14. Author: Sergey Mastitsky Измените путь к папке (ее нужно сначала создать!), куда вы хотели бы устанавливать все дополнительные пакеты, например: # set a site library .Library.site <- "c:UsersMastitSEMyRlibs"
  • 15. Командная строка: здесь мы общаемся с R Author: Sergey Mastitsky
  • 16. • Интегрированная среда разработки (IDE) для R • Сочетает интуитивный интерфейс с мощными средствами для разработки кода R Author: Sergey Mastitsky
  • 19. Author: Sergey Mastitsky Поступаем так же, как и при установке R …
  • 20. Консоль R: здесь мы общаемся с R, вводя команды Редактор кода Служебное окно 1 Author: Sergey Mastitsky Служебное окно 2
  • 21.  Зайдите на сайт R Project и ознакомьтесь с его основными разделами  Из раздела “Documentation/Manuals” загрузите PDF-файлы “An Introduction to R” и “R Data Import/Export” – настоятельно рекомендую к изучению!  Обратите внимание на раздел “Documentation” Author: Sergey Mastitsky
  • 22.  Зайдите на сайт r-analytics.blogspot.com  Зайдите на страницу “Работа с RStudio” – здесь вы можете подробнее узнать о работе с этим инструментом и найти PDF-файл руководства на русском языке  Обратите внимание на разделы “Инсталляция R” и “Библиотека” Author: Sergey Mastitsky