2. Ewan Birney, глава отдела «Nucleotide Data» в European
Bioinformatics Institute, EMBL
Из сообщения в его блоге “Five statistical things I wished I had been
taught 20 years ago”
Методы непараметрической статистики
R
Проблема множественных сравнений
Связь между Р-значением, размером
эффекта и объемом выборки
Линейные модели и PCA
Author: Sergey Mastitsky
3. Абсолютно бесплатно – особенно важно для
академических учреждений
Язык, специально созданный для стат. анализа
Огромные возможности для визуализации
данных
Более 5000 пакетов-расширений
Развивается быстрее любого коммерческого ПО
Сотни книг, “The R Journal”, “Journal of Statistical
Software”
Огромное число пользователей (>2 млн., 2012 г.)
= поддержка, быстрое исправление ошибок
Author: Sergey Mastitsky
4. Работа из командной строки – не то, что
ожидают пользователи, привыкшие
«нажимать на кнопки»
R – это язык (требует времени для изучения)
Справочная информация зачастую написана
сухим техническим [английским] языком –
новички часто теряются и расстраиваются
Author: Sergey Mastitsky
5. Книги – в основном издаются Springer,
Cambridge University Press и
Chapman & Hall
Блоги – чрезвычайно ценный источник:
r-bloggers.com
r-analytics.blogspot.com
Специальные курсы, в т.ч. онлайн:
coursera.com (бесплатно/платно)
statistics.com (платно)
Author: Sergey Mastitsky
6. Основные принципы работы с R и RStudio
Описательная статистика, основы R-графики,
классические статистические методы (t-тест,
ANOVA, корреляционный анализ)
Простая и множественная регрессия
В конце: вы получите все материалы курса,
включая примеры кода, пригодные для
повторного использования
Author: Sergey Mastitsky
7. Я объясняю новые понятия и привожу
примеры – вы повторяете
Я даю небольшие задания – вы
выполняете
Author: Sergey Mastitsky
12. … потом следуйте инструкциям
Author: Sergey Mastitsky
Что выбрать:
- Если у вас есть права
Администратора: C:Program Files
- Если нет: любая директория,
которая вам нравится.
13. Author: Sergey Mastitsky
• Если система R установлена в C:Program Files,
пропустите этот шаг
• Иначе:
- Заходим в папку, где находится R, например:
C:UsersMastitSER-2.15.0
- Идем в C:UsersMastitSER-2.15.0etc и
открываем файл Rprofile.site в текстовом
редакторе (лучше всего Notepad)
14. Author: Sergey Mastitsky
Измените путь к папке (ее нужно сначала создать!), куда
вы хотели бы устанавливать все дополнительные пакеты,
например:
# set a site library
.Library.site <- "c:UsersMastitSEMyRlibs"
20. Консоль R: здесь мы
общаемся с R, вводя
команды
Редактор кода
Служебное окно 1
Author: Sergey Mastitsky
Служебное окно 2
21. Зайдите на сайт R Project и ознакомьтесь с его
основными разделами
Из раздела “Documentation/Manuals” загрузите
PDF-файлы “An Introduction to R” и “R Data
Import/Export” – настоятельно рекомендую к
изучению!
Обратите внимание на раздел “Documentation”
Author: Sergey Mastitsky
22. Зайдите на сайт r-analytics.blogspot.com
Зайдите на страницу “Работа с RStudio” –
здесь вы можете подробнее узнать о работе с
этим инструментом и найти PDF-файл
руководства на русском языке
Обратите внимание на разделы “Инсталляция
R” и “Библиотека”
Author: Sergey Mastitsky