CMV TQ.pptx
- 2. TCH CHI畉T CMV - DNA
Kit th動董ng m畉i: QIAamp速DNA Mini and Blood
Mini kit
働u i畛m:
Thao t叩c nhanh, d畛 dng, ch鱈nh x叩c
Ly tr鱈ch DNA ton ph畉n
B畛nh ph畉m: m叩u ton ph畉n, huy畉t t動董ng, huy畉t
thanh, t畛y x動董ng, c叩c d畛ch c董 th畛 kh叩c, d畛ch nu担i
c畉y t畉 bo, c叩c m畉u ph叩p l箪.
Th畛i gian th畛c hi畛n: 20 ph炭t
S畛 d畛ng 動畛c v畛i m叩u t動董i ho畉c 担ng l畉nh, m叩u
ch畛ng 担ng b畉ng citrat, heparin, EDTA
- 3. Qui tr狸nh th畛c hi畛n
Ly gi畉i m畉u (200 ul m叩u ton ph畉n/huy畉t thanh)
B叩m mng
R畛a l畉n 1
R畛a l畉n 2
H嘆a tan DNA
PCR/Realtime PCR
- 4. S畉n ph畉m #
100 bp
CMV - DNA
PCR
S畉n ph畉m #
97 bp
-globin
DNA
PCR
畉u 5 t畛 do c畛a TQ probe ph叩t hu畛nh
quang
CMV TQ PCR
Nguy棚n t畉c
- 5. CMV TQ PCR
T棚n thu畛c th畛 Thnh ph畉n S畛 l動畛ng K b畉o qu畉n
NKCMV-TQPCRFAM
Mix
M畛i 1 & 2, MgCl2,
Tris HCl, KCl, taq
polymerase, dNTP,
TQ probe (FAM)
175l x 9 tubes -18o 畉n -30oC
NKHBG-TQPCRFAM
Mix
M畛i 1 & 2, MgCl2,
Tris HCl, KCl, taq
polymerase, dNTP,
TQ probe (FAM)
175l x 6 tubes -18o 畉n -30oC
NKCMVDNA chu畉n Plasmid ch竪n
CMVDNA, 動畛c
cung c畉p 畛 3 畛 pha
lo達ng cho bi畉t n畛ng
畛 copies/th畛 t鱈ch
(5l)
3 tube x 2 -18o 畉n -30oC
Ch畛ng tr畉ng TE1X 100 l x 1 -18o 畉n -30oC
Tube PCR Low
profile white
D但y n畉p + d但y tube RT
- 6. Chu畉n CMV
Ch畛ng tr畉ng
DNA t叩ch chi畉t t畛
M1
CMV-qPCR HBG-qPCR mix
5l 5l
CMV-qPCR
CMV-DNA
chu畉n 105
5l
CMV-qPCR
5l
CMV-DNA
chu畉n 104
DNA t叩ch chi畉t t畛
M2
CMV-qPCR HBG-qPCR mix
5l 5l
Ch畛ng tr畉ng
TE1X
CMV-qPCR HBG-qPCR mix
5l 5l
CMV-qPCR
5l
CMV-DNA
chu畉n 103
M畉u th畛
- 7. Gi叩m s叩t 畛 nh畉y c畛a CMV-qPCR mix
Ct
C叩ch bi畛t Ct l箪
t動畛ng
gi畛a hai chu畉n
Chu畉n
Copies/ph畉n
畛ng
Ct
C叩ch bi畛t Ct l箪
t動畛ng
gi畛a hai chu畉n
Chu畉n
Copies/ph畉n
畛ng
40.00 3.32 0 26.72 3.32 1,000
36.68 3.32 1 23.40 3.32 10,000
33.36 3.32 10 20.08 3.32 100,000
30.04 3.32 100 16.76 3.32 1,000,000
- 9. Gi叩m s叩t kh畉 nng t叩ch chi畉t DNA t畛
m畉u th畛
Ki畛m ch畛ng b畉ng gen m達 h坦a -globin c畛a
ng動畛i
T叩ch chi畉t t畛t + PCR mix t畛t NKHBG-TQPCRFAM
s畉 c坦 動畛ng bi畛u di畛n khu畉ch 畉i (k棚n FAM)
N畉u kh担ng c坦 動畛ng bi畛u di畛n khu畉ch 畉i gen
硫-globin c畛a m畉u m畉u b畛 畛c ch畉 hay t叩ch
chi畉t DNA kh担ng t畛t T叩ch chi畉t l畉i DNA t畛
m畉u
- 10. 畛nh l動畛ng tuy畛t 畛i s畛 l動畛ng copies
CMV ban 畉u
S畛 l動畛ng copies CMV-DNA ban 畉u c坦 trong
m畉u th畛 畛nh l動畛ng 動畛c ch鱈nh l SQ c坦 trong
th畛 t鱈ch m畉u 動a vo ph畉n 畛ng
H畛 s畛 K: h畛 thu h畛i sau t叩ch chi畉t c畛a m畉u v
th畛 t鱈ch m畉u 動畛c t叩ch chi畉t
- 11. 200 ul m叩u ton ph畉n
QIAamp DNA
200 ul DNA 動畛c t叩ch chi畉t
5ul DNA 動畛c ch畉y PCR
x copies/ph畉n 畛ng
200x copies/ml m叩u
K = 200
- 12. 畛nh l動畛ng t動董ng 畛i s畛 CMV ban 畉u
t畛 l畛 CMV-DNA ph叩t hi畛n 動畛c so v畛i kh畛i
l動畛ng c畛a m畉u th畛
kh担ng th畛 畛nh l動畛ng m畛t c叩ch ch鱈nh x叩c l
bao nhi棚u gram hay bao nhi棚u ml
T畛 l畛 nhi畛m CMV c畛a m畉u so v畛i kh畛i l動畛ng
c畛a m畉u:
Ct[HBG] v畛i Ct[CMV] = Ct[HBG]/Ct[CMV]