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Cython
ことはじめ
IGGG Meetup 2015 Spring
擬音 @gion_U
お前誰よ
? 擬音 @gion_U
? 興味
? Python / Web開発
? バイトしてた
? やってること
? 研究室で MATLAB 使って線形代数こねこね
? (パターン認識?機械学習)
sucks
>> A
A =
1 2 3
4 5 6
7 8 9
>> sum(A)
ans =
12 15 18
>> sum(A, 1)
ans =
12 15 18
>> sum(A, 2)
ans =
6
15
24
>> A
A =
1 2 3
4 5 6
7 8 9
>> sum(A)
ans =
12 15 18
>> sum(A, 1)
ans =
12 15 18
>> sum(A, 2)
ans =
6
15
24
b =
1 2 3
>> A
A =
1 2 3
4 5 6
7 8 9
>> sum(A)
ans =
12 15 18
>> sum(A, 1)
ans =
12 15 18
>> sum(A, 2)
ans =
6
15
24
b =
1 2 3
>> sum(b)
ans =
6
>> A
A =
1 2 3
4 5 6
7 8 9
>> sum(A)
ans =
12 15 18
>> sum(A, 1)
ans =
12 15 18
>> sum(A, 2)
ans =
6
15
24
b =
1 2 3
>> sum(b)
ans =
6
I ?
スクリプト言語なので、
どうしても?
コンパイラ言語より遅い
I ?
Cython ことはじめ
[Cython] is a programming
language that makes
writing C extensions for the
Python language as easy as
Python itself.
http://cython.org/docs/current/src/quickstart/overview.html
http://cython.org/docs/current/src/quickstart/overview.html
Python書くくらいの?
気軽なノリで?
C 拡張が書ける言語だよ!
特徴
? “Pythonic”
? Python コードに型情報付けた感じ
? Python 向け C 拡張ライブラリとしてビルドで
きる他に、Cython コードを実行形式バイナリ
としてビルドすることも可能
? 変数の型宣言(しなくてもよい)
? Python の型も使える
? Python っぽいコード
def newton(double init):
cdef list result = []
cdef double current = init
cdef double past = 0
while True:
past = current
current = (current + (7 / current)) / 2
if abs(current - past) < 1e-10:
break
result.append(current)
return result
if __name__ == '__main__':
print(newton(3))
CPython から使う
1. pip install cython
2. Cython コードを .pyx として保存
3. import pyximport?
pyximport.install()
4. import <module_name>
5. コンパイルされる。エラーが発生しなければ成功
実行形式バイナリの生成
? 前ページの Cython コードから?
次のようにして生成
% cython newton_pyx.pyx --embed
% cc -I${PYTHON_INCLUDE_DIR} -L{PYTHON_LIBRARY_DIR} 
-lpython3.4 newton_pyx.c
% ./a.out
[2.666666666666667, 2.645833333333333, 2.6457513123359577,
2.6457513110645907]
ここではやってないけれど
? 外部のソースの関数なども extern で?
持ち込める
? よく使われそうな定義は予め用意されている
? CPython, C, C++, NumPy, POSIX
※ C++ コードを生成できる
cdef extern from "myfuncs.h"
double func(double x, int y)
from libc.math cimport sin
速度計測
? ハードウェア環境
? MacBook Pro Retina 13” (Mid 2013)
? Core i5, 16G RAM
? ソフトウェア環境
? Mac OS X 10.10
? Python 3.4.3 (from Homebrew [bottle])
? Cython 0.22
? Clang 3.5.1 (tags/RELEASE_351/?nal)
? 4 つのモジュールを作成
? newton
? 素の Python, 漸近のようすを表すリストを返す
? newton2
? 素の Python, 漸近の结果を返す
? newton_pyx
? newton2_pyx
? 上記の 2 モジュールの Cython 実装
速度計測
(ニュートン法による関数近似)
? timeit.repeat(repeat=10, ...)?
の最小値
? 100 万回の実行を?
10 セット行ったときの最小時間
速度計測
(ニュートン法による関数近似)
结果
结果
? Python
? newton - 2.36 sec
? newton2 - 1.83 sec
结果
? Python
? newton - 2.36 sec
? newton2 - 1.83 sec
? Cython
? newton_pyx - 0.27 sec
? newton2_pyx - 0.17 sec
Cython つよい
ところで
Python の関数
? 呼び出しに伴うコストが大きい
? 関数もオブジェクト
? ルックアップ、引数渡し、……
? ループ中で呼んだり、?
再帰したりで遅くなりがち
Cython の関数定義
? Cython では、Python 関数だけでなく?
C 関数も定義できる(Pythonic に!)
? C 関数は Python コードから?
直接呼びだせないことに注意
? cdef キーワードで定義
? cpdef キーワードを用いると、?
Python からは Python 関数を、?
C からは C 関数を呼んでくれる(はず)
cpdef int tarai(int x, int y, int z):
if x <= y:
return y
else:
return tarai(
tarai(x-1, y, z),
tarai(y-1, z, x),
tarai(z-1, x, y)
)
たらい回し関数(竹内関数)
? 再帰関数
? 計算対象の数が大きくなりすぎない
? 再帰のネストが深くなりすぎない
? 関数呼び出しのベンチマークに使える
http://ja.wikipedia.org/wiki/竹内関数
検証
(たらい回し関数の呼び出し)
? 3 通りの方法で関数呼び出しの速度を検証
1. Python コードをそのまま実行
2. Cython コード(Python 関数版)を実行
3. Cython コード(C 関数版)を実行
検証
(たらい回し関数の呼び出し)
? timeit.repeat(number=1) の最小値
? 『1回実行』を 10 セット行ったときの?
最小時間
? すごい時間がかかったので
结果
结果
? Python - 38.8 sec
结果
? Python - 38.8 sec
? Cython(Python func) - 21.2 sec
结果
? Python - 38.8 sec
? Cython(Python func) - 21.2 sec
? Cython(C func) - 0.558 sec (!)
? 69 times faster than Python
? 37 times faster than Cython(Python func)
まとめ
? Pythonic なコードから C/C++ ソースを?
生成する Cython
? 気軽に C 拡張を書ける
? 型指定は積極的に
? 関数は極力 C 関数として定義する
? 数値演算などに威力を発揮しそう

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Yusaku Watanabe
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Cython ことはじめ