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QGISプラグイン Home range estimation with Rインストールマニュアル
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Hiroaki Ishii
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QGIS1.7.xにHome range estimation with R 通称Home range プラグインをインストールする方法をまとめました。
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QGISプラグイン Home range estimation with Rインストールマニュアル
1.
QGISへのHomerangeツールのイ ンストールマニュアル 2013秋 農工大M2 石井宏章
2.
概要 Home range?analysis プラグイン 側位点の シェープファイル(.shp) 行動圏の シェープファイル(.shp) Python というプログラム 言語による仲介 「プラグイン」 Rのパッケージ ?rgdal ?gpclib ?shapefiles ?adehabitat を用いて計算?作図 GISデータを描画するソフト:QGIS?QGISの中で動くプラグイン プラグインを介して投げられたデータの統計計算をするソフト:R プラグインはQGISの中に入っているの で、RとQGISをインストールします。
3.
用意するファイル ①QGIS1.7.1?インストールファイル “QGIS‐OSGeo4W‐1.7.1‐c58071d‐Setup” (1.7.4と1.8.0だと動かなかった。2.0.1にはプラグインが無い?) ②R?2.11.0?インストールファイル “R‐2.11.0‐win32”
4.
インストール?設定の流れ 1.?QGIS1.7.1をインストール 2.?R2.11.0をインストール 3.?Rにてパッケージをインストール “rgdal”?,“gpclib”,“shapefiles”,“adehabitat” 4.?パソコンのシステム環境の設定 5.?QGISでプラグインをインストール
5.
①QGISのインストール ? http://qgis.org/downloads/ から“QGIS‐OSGeo4W‐1.7.1‐c58071d‐Setup.exe” を選んでダウンロード 基本的にyesを押していればOK
6.
2-1.Rのダウンロード Googleで”R”で検索すると二番目に出てくる “The R Project?for?Statistical?Computing”に行きますhttp://www.r‐project.org/ “dounload?R”をクリック いろんな国からダウンロードできますが とりあえず一番近い Japanのhttp://cran.ism.ac.jp/ をクリック
7.
2-1.Rのダウンロード 初めに出てくるのは最新バージョン(3.0.2) ですが、旧バージョン(2.11.0)が欲しいので 旧バージョンのダウンロード画面まで行き、 OSに合ったものをダウンロードします。 パソコンのOSを選択 “install?R?for?the?first?time.” をクリック “Previous?releases”から旧バージョ ンのダウンロード画面へ進み R2.11.0?を選択、OSを選択してダ ウンロード
8.
2-2.Rのインストール ダウンロードしたセットアップファイルを クリックし言語を選んであとはYes連打で とりあえずインストール完了 ※Rのインストール先をメモしておいてください。 大抵は “C:?Program?Files?(x86)?R?R‐2.11.0”
9.
3-1.Rにてパッケージのインストール Rを起動し、4つのパッケージをインストールします install.packages("rgdal",dep=TRUE) install.packages("gpclib",dep=TRUE) install.packages("shapefiles",dep=TRUE) install.packages("adehabitat",dep=TRUE) ? コンソールにこの↑4行をコ ピペすると、インストールが 始まります。 ? 言語は日本語、パッケージ のダウンロード元は一番近 いTokyoを選択してください ※Rのインストール先とは別の場所にパッケージはインストールされ ますので、インストール先をメモしておいてください。 大抵は
“颁:?鲍蝉别谤蝉?ユーザ名?顿辞肠耻尘别苍迟蝉?搁?飞颈苍‐濒颈产谤补谤测?2.11”
10.
3-2.Rにてパッケージのインストール インストールされたパッケージを、インストール先から 別のフォルダにコピーします “颁:?鲍蝉别谤蝉?ユーザ名?顿辞肠耻尘别苍迟蝉?搁?飞颈苍‐濒颈产谤补谤测?2.11” の中身を “C:?Users?ユーザ名?R?win‐library?2.11” というファイルを作ってコピーします。 ? Documentと同じ階層 に”R”というフォルダを 作ります。
11.
4-1.パソコンのシステム環境の設定 QGISのホームレンジプラグインが、Rのパッケージを認 識するようにするため、環境設定を行います。 ? コントロールパネルを開 き、クラシック表示また はアイコン表示にする ? システムを選択 ?
システムの先は システム→システムの詳細設定→システム環境変数 まで行き、そこから詳細の設定を行います
12.
4-2.システム環境変数の変更 ? 「システム環境変数」の中から”Path” を選択、編集をクリックします。 ? 「システム変数の編集」が開きます ?
Rのソフトがインストールされているフォ ルダのうち、binフォルダのあるアドレス “; C:?Program?Files?(x86)?R?R‐2.11.0?bin” を変数値の最後に追加。 “;”を忘れないでください。入力したらOKを クリック
13.
4-3.システム環境変数の変更 ? 「システム環境変数」の新規をクリック ? 「新しいシステム変数」が空欄で出 てくるので 変数名に“R_HOME” 変数値に“C:?Program?Files?(x86)?R?R‐2.11.0” (Rのソフトがインストールされているフォルダのアドレス) を入力して、OKをクリック ?
最後に、環境変数までもどったらOKを 押して終了、パソコンを再起動してQGIS でのプラグインインストールに移ります。
14.
5-1.QGISでプラグインをインストール ? QGISを起動します ? プラグインをインストールするにはネットに接続する必要があるので、 ネットにつなげてください ?
メニューにある“プラグイン”にある“Pythonプラグインを呼び出す”を クリック ? 「リポジトリの取得」というウィンドウが出てきます。ちゃんとネットにつ ながっていると、“状態”の部分に“成功”と表示されます(左図) ? いくつかのリポジトリには接続できませんが、虫して進めると、右図 のようなプラグインの一覧が出てくるはずです。
15.
5-1.QGISでプラグインをインストール ? 左の欄が「未インストール」のプラ グインが一覧で出ない場合は、 ウィンドウ内 “リポジトリ” のタブに移動し、 “サードパーティーのリポジトリを追加” をクリックして、サードパーティー (QGISの開発者以外の開発者)が 公開しているプラグインを取得で きるようにしてください。 それが完了したら“プラグイン”のタ ブに戻ります。
16.
5-1.QGISでプラグインをインストール ? 未インストール状態の”HomeRange_Plugin”があると思います ので、それをクリックして、インストールしてください。 ? “壊れています”などのメッセージが出る場合は、一度プラグイ ンをアンインストールした後、リポジトリの追加をして、再びイン ストールをすればできたりします。 ?
プラグインインストーラから 「HomeRange_Plugin」をインストール
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