Replikasyon
- 2. Replikasyon Balang脹巽 Noktas脹 13 bazl脹k 3 tekrar dizisi dnaA proteininin balanma b旦lgesi ~250 b巽
- 3. Replikasyon Balang脹巽 Noktas脹 dnaA kutusu dnaA kutusu dnaA kutusu dnaA kutusu ?
- 4. DNAn脹n A巽脹lmas脹 ATce zengin b旦lgeler dnaA kutusu dnaA proteini helikaz helikaz DNA giraz kinolon
- 5. DNAn脹n A巽脹lmas脹 DNA polimeraz helikaz kompleksi DNA polimeraz
- 6. DNA Polimeraz Polimerazlar, nukleotidleri bir araya getiren enzimlerdir. Bakteri h端crelerinde, hem DNA replikasyonunda hem de DNA onar脹m脹nda farkl脹 rolleri olan 巽eitli DNA polimerazlar vard脹r. DNA polimeraz DNAy脹 sadece 5 3 y旦n端nde sentez edebilir !!! 聴kili sarmal脹n duplikasyonundan tek bir replikasyon 巽atal脹 sorumludur. SONU: yeni ipliklerden sadece bir tanesinde Replikasyon s端rekli, dierinde ise par巽al脹 yap脹labilir. Tek par巽a halinde yap脹lan iplik 旦nden giden ve kesintili olarak yap脹lan iplik ise arkadan gelen olarak nitelendirilir.
- 7. Replikasyon atal脹nda Kesintili ve Kesintisiz DNA Sentezi Replikasyon 巽atal脹nda DNA polimeraz DNAy脹 her zaman 5-3 y旦n端nde sentez eder. Bu nedenle yeni ipliklerden biri kesintili (yani k脹sa par巽alar halinde) olarak yap脹l脹rken (arkadan gelen iplik) dier iplik ise (旦nden giden iplik) kesintisiz (s端rekli) olarak yap脹l脹r. 旦nden gelen iplik arkadan gelen iplik kesintili replikasyon kesintisiz replikasyon okazaki fragmenti
- 8. 仰plik oluumunun balamas脹 i巽in k脹sa bir RNA primerinin sentezi gerekir. Yeni bir iplie balamak i巽in DNA polimeraz, baka bir enzim taraf脹ndan yap脹lan k脹sa RNA primerini kullan脹r. Primaz (DnaG proteini) ad脹 verilen 旦zel bir RNA polimeraz, bakteride DNA sentezi s脹ras脹nda iplik balat脹lmas脹ndan sorumlu olan RNA primerlerini yapar. 驚nden giden ipliin bir kere balat脹lmas脹 yeterlidir, arkadan gelen iplik k脹sa par巽alar halinde yap脹ld脹脹ndan ve her yeni b旦l端m yap脹ld脹脹nda yeni bir RNA primerin eklenmesi gerekir. DNA polimeraz, her bir RNA primerinden balayarak yeni DNA iplikleri oluturmaya balar. RNA Primerinin Eklenmesi RNA primaz topoizomeraz helikaz SSB protein
- 9. Nukleotidlerin Polimerizasyonu DNA ya da RNA olsun, t端m n端kleik asitler 5-3 y旦n端nde sentez edilir. Yeni n端kleik asitler uzayan zincirin 3- ucundaki hidroksil grubuna eklenir. DNA sentezinin 旦nc端lleri, deoksiribonukleosid 5-trifosfatlard脹r (deoksi-NTPler) dATP, dGTP, dCTP ve dTTP. Deoksiribozdan d脹ar脹 doru, 端巽 fosfat grubu alfa, beta ve gamma fosfatlar olarak tasarlanm脹t脹r. Polimerizasyondan sonra, alfa ve beta fosfatlar aras脹ndaki y端ksek enerjili balar kopar ve polimerizasyonu y端r端tecek enerjiyi ortaya 巽脹kar脹r. En d脹taki iki fosfat (beta ve gamma fosfatlar) pirofosfat molek端l端 olarak a巽脹a 巽脹karlar. Yeni gelen nukleotidin en i巽teki fosfat脹 (alfa fosfat) ve uzayan zincirin ucundaki bir 旦nceki nukleotidin 3-hidroksil (3-OH) grubu aras脹nda yeni bir ba kurulur.
- 10. DNA Replikasyonunun Sona Ermesi Replikasyon iki replikasyon 巽atal脹n脹n DNA 端zerinde kar脹lat脹klar脹 yerde sona erer. Bu b旦lge replikasyonun 巽atal脹n脹n daha ileri gitmesini engelleyen birka巽 ter b旦lgesiyle sar脹lm脹t脹r. Ter b旦lgeleri asimetrik olarak hareket eder terC, terB ve terF 巽atallar脹n saat y旦n端nde hareketini engellerken terA, terD ve terF saat y旦n端ndeki hareketini engellerler.
- 11. Halkasal DNAn脹n replikasyonu sona erdiinde, iki yeni halka fiziksel olarak birbirine ge巽mi ya da zincir oluturmu olabilir. Bu t端r zincirlemeler her yavru h端crenin h端cre b旦l端nmesyle tek bir DNA alabilmesi i巽in birbirinden ayr脹lmas脹 gerekir. Birbirine ge巽mi halkalar topoizomeraz IV taraf脹ndan 巽旦zd端r端l端r. Topo IV replikasyon 巽atal脹n脹n arkas脹nda bulunur ve replikasyon ilerledik巽e yeni oluturulmu DNAy脹 ay脹r脹r. Yeni Oluan DNAlar脹n Ayr脹lmas脹 replikasyon topoizomeraz IV
- 12. E.coli de replikasyon s端resi 40 dakika s端rerken, b旦l端nme s端resi 20 dakikad脹r. NASIL ?
- 13. 舘珂