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高雄医学大学生物暨环境学系暑期实习成果之心得报告
                               長榮大學生物科技系
                          指導老師: 李瑞年 老師  余俊杰 學長
                           學生:吴俊宏       系級:生科4A                                                       學號:I44711421
                     Association of single nucleotide polymorphism of LIPC
                      Predict to development the type II diabetes mellitus
                              LIPC基因多型性的第二型糖尿病發展預測
Abstract
糖尿病(Diabetes mellitus)病患共同擁有的特徵就是高血
                                                             (圖三)經PCR跑完膠後確認無汙染,再用Dra1限制酶切割後跑
糖 ,近幾年來糖尿病一直是國人的十大死因之一,據估計,
                                                             電泳完照UV光後產物可比照(圖二)判斷哪一種band的位置是哪
糖尿病人中,約90-95%是屬於非胰島素依賴型或稱為第二型糖
                                                             一個基因型。
尿病。根據文獻的探討我們可知人體有好幾個基因跟第二型糖
                                                                                                          50                                                                          45
尿病有關。由於SNP的產生可能會造成蛋白質表現的改變,所                                                                              40
                                                                                                                                                                  32
以SNP也成為影響人類體質的關鍵,使人可能特別容易或特別




                                                                         counts
                                                                                                          30

不容易患上某些疾病,在現代科技中SNP廣泛被應用於(1)尋找                                                                            20
                                                                                                                          13

致病基因(2)診斷及預測致病風險(3)藥物基因體學及新藥的發                                                                            10


現(4)生物晶片快速檢測(5)研究族群演化。所以針對不同的基                                                                                0
                                                                                                                          AA                                      GG                  GA
因做分析,來評估高風險,中度風險,和低風險群做個區別藉
                                                             (圖四)每一種基因型空腹血糖值≧100在該基因所占人數,將此
此來達到個人身體健康預警。
                                                             空腹血糖值≧100視為Pre-DM。
Subject and Method                                                                                                                                                                    29




                                                                  Counts of fasting plasma
                                                                  glucose of over the levels
                                                                                                      30

                                                                                                                    24.1
                                                                                                      25
試驗大致程序                                                                                                20
                                                                                                                                                                21.2


(1)抽血液DNA:                                                                                            15


將血液依序加入所需的藥品及容量即可將血液DNA抽取出來。                                                                   (%)    10


(2)測定DNA濃度及OD值:                                                                                           5

                                                                                                          0
將抽取的DNA測OD值,方可知道DNA純度及濃度好方便稀釋。                                                                                       AA                                          GG                   GA


(3)PCR:                                                      (圖五)將(圖四)各基因型統計出Pre-DM在個基因型所佔比例。
稀釋好的DNA濃度依序加入PCR所需的藥品。跑膠完,測UV確                               30                                                                                            40
定有無產物。




                                                                                                                                             血糖超標所佔比例(%)
                                              BMI(體重/身高平方)




                                                                                                              實際值   標準值    實際值

(4)Dra1限制酶切割(restriction enzyme):                                                              標準值
                                                                                                                                                           30
                                                             20
確定PCR無汙染和確定有產物時方可加入限制梅和所需的藥
品。                                                                                                                                                         20


(5)電泳分析基因型:                                                  10

將限制酶切割完的膠拿去照UV確定有無切割,方可判斷                                                                                                                                  10


Sample的基因型。                                                   0
                                                                                                                                                            0
                                                                                                     女生              男生
                                                                                                                                                                           男生              女生


Result                                        (圖六)男女生平均BMI,經所 (圖七)所有受試者依性別判斷血糖
                                              有受試者平均的身高與體重去 ≧100超標值所佔比例。
                                              計算BMI所得為實際值。標準
                                              值為平均受試者年齡去判斷該
                                              標準值為多少。          40

                                                                                                                                                 35
                                                                                                                                 Counts(%)




                                                                                                                                                 30

                                                                                                                                                 25

                                              (圖八)依性判斷超標血                                                                                        20
(圖一)DNA萃取完經過稀釋定量後跑PCR,PCR完照UV光的
                                              糖≧100在各類型基因統                                                                                       15

產物膠圖,約為700 bp。                                                                                                                                   10
                                              計出在男生(左)與女生                                                                                           5

                                              (右)間所佔比例為多少。                                                                                          0
                                                                                                                                                           GA         GG    AA   GA        GG   AA

                                                                                                                                                                 男生                   女生
(圖二)依此圖可看出利用Dra1限制酶切割PCR產物後大小, Conclution
                                           從圖(六)中發現女生的BMI是超標的可是男生卻是正常的,但是從圖
可利用此圖判斷(圖三)膠圖。(來源:余俊杰學長)
                                           (七)中看出男生Pre-DM的比例遠高於女生,初步判斷可能與BMI圖
                                           (六)和身高(NO SHOW)無直接相關。再來是看基因型從圖(四)中看出
                                           血糖超標攜帶GA基因型的人比較多,接著從圖(八)中看出男生攜帶
                                           GA型的人較多雖然女生是攜帶AA型的人較多但GA型的人也是位居第
                                           二,從以上判斷我們一開始推論可能與性別無直接相關性,那麼剔
                                           除性別之分的話可以找出GA型基因的人Pre-DM的機率是比其他兩型
                                           的人還要高的。所以結論就是GA型的人羅患糖尿病的機率是比較高
                                           的。
                                           誌謝
                                            感謝這兩個月待在高醫的日子,謝謝李老師和學長還有同學的教導,
 GG        MARKER    GA    AA               每當我有很多問題時他們總會不厭其煩和有耐心的為我講解,這時才
                                            體會互相學習的那種感覺,謝謝他們這段期間讓我學習這麼多東西。

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吴俊宏

  • 1. 高雄医学大学生物暨环境学系暑期实习成果之心得报告 長榮大學生物科技系 指導老師: 李瑞年 老師 余俊杰 學長 學生:吴俊宏 系級:生科4A 學號:I44711421 Association of single nucleotide polymorphism of LIPC Predict to development the type II diabetes mellitus LIPC基因多型性的第二型糖尿病發展預測 Abstract 糖尿病(Diabetes mellitus)病患共同擁有的特徵就是高血 (圖三)經PCR跑完膠後確認無汙染,再用Dra1限制酶切割後跑 糖 ,近幾年來糖尿病一直是國人的十大死因之一,據估計, 電泳完照UV光後產物可比照(圖二)判斷哪一種band的位置是哪 糖尿病人中,約90-95%是屬於非胰島素依賴型或稱為第二型糖 一個基因型。 尿病。根據文獻的探討我們可知人體有好幾個基因跟第二型糖 50 45 尿病有關。由於SNP的產生可能會造成蛋白質表現的改變,所 40 32 以SNP也成為影響人類體質的關鍵,使人可能特別容易或特別 counts 30 不容易患上某些疾病,在現代科技中SNP廣泛被應用於(1)尋找 20 13 致病基因(2)診斷及預測致病風險(3)藥物基因體學及新藥的發 10 現(4)生物晶片快速檢測(5)研究族群演化。所以針對不同的基 0 AA GG GA 因做分析,來評估高風險,中度風險,和低風險群做個區別藉 (圖四)每一種基因型空腹血糖值≧100在該基因所占人數,將此 此來達到個人身體健康預警。 空腹血糖值≧100視為Pre-DM。 Subject and Method 29 Counts of fasting plasma glucose of over the levels 30 24.1 25 試驗大致程序 20 21.2 (1)抽血液DNA: 15 將血液依序加入所需的藥品及容量即可將血液DNA抽取出來。 (%) 10 (2)測定DNA濃度及OD值: 5 0 將抽取的DNA測OD值,方可知道DNA純度及濃度好方便稀釋。 AA GG GA (3)PCR: (圖五)將(圖四)各基因型統計出Pre-DM在個基因型所佔比例。 稀釋好的DNA濃度依序加入PCR所需的藥品。跑膠完,測UV確 30 40 定有無產物。 血糖超標所佔比例(%) BMI(體重/身高平方) 實際值 標準值 實際值 (4)Dra1限制酶切割(restriction enzyme): 標準值 30 20 確定PCR無汙染和確定有產物時方可加入限制梅和所需的藥 品。 20 (5)電泳分析基因型: 10 將限制酶切割完的膠拿去照UV確定有無切割,方可判斷 10 Sample的基因型。 0 0 女生 男生 男生 女生 Result (圖六)男女生平均BMI,經所 (圖七)所有受試者依性別判斷血糖 有受試者平均的身高與體重去 ≧100超標值所佔比例。 計算BMI所得為實際值。標準 值為平均受試者年齡去判斷該 標準值為多少。 40 35 Counts(%) 30 25 (圖八)依性判斷超標血 20 (圖一)DNA萃取完經過稀釋定量後跑PCR,PCR完照UV光的 糖≧100在各類型基因統 15 產物膠圖,約為700 bp。 10 計出在男生(左)與女生 5 (右)間所佔比例為多少。 0 GA GG AA GA GG AA 男生 女生 (圖二)依此圖可看出利用Dra1限制酶切割PCR產物後大小, Conclution 從圖(六)中發現女生的BMI是超標的可是男生卻是正常的,但是從圖 可利用此圖判斷(圖三)膠圖。(來源:余俊杰學長) (七)中看出男生Pre-DM的比例遠高於女生,初步判斷可能與BMI圖 (六)和身高(NO SHOW)無直接相關。再來是看基因型從圖(四)中看出 血糖超標攜帶GA基因型的人比較多,接著從圖(八)中看出男生攜帶 GA型的人較多雖然女生是攜帶AA型的人較多但GA型的人也是位居第 二,從以上判斷我們一開始推論可能與性別無直接相關性,那麼剔 除性別之分的話可以找出GA型基因的人Pre-DM的機率是比其他兩型 的人還要高的。所以結論就是GA型的人羅患糖尿病的機率是比較高 的。 誌謝 感謝這兩個月待在高醫的日子,謝謝李老師和學長還有同學的教導, GG MARKER GA AA 每當我有很多問題時他們總會不厭其煩和有耐心的為我講解,這時才 體會互相學習的那種感覺,謝謝他們這段期間讓我學習這麼多東西。