أصدر محمد علي في مارس 1827م أوامره ببناء مستشفى أميري يكون مقره الإسكندرية بغرض خدمة جنود البحرية، وعرف باسم مستشفى البحرية. وافتتح عام 1830م، وتوجد حالياً لوحة رخامية على باب المستشفى الأميري كُتب عليها هذا التاريخ. ويدل ذلك على أن المستشفى الأميري الموجود الآن هو سليل هذا المستشفى البحري. وكان في بداية افتتاحه يسع 1500 مريض، وهو وإن بني أصلاً للبحرية، فقد ألحق به مبنى جديد لعلاج المدنيين في عام 1846م. وخصص قسم منه لاستقبال الحوامل لأول مرة في مصر. وأوكل إلى أنطوان برتيميلي كلوت بك أمر تنظيم المستشفى طبقاً للنظم الأوروبية.