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SPARQL クエリの実行（青空文庫のデータ）
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PREFIX rdf:<http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>
PREFIX dcterms:<http://purl.org/dc/terms/>
PREFIX dcndl:<http://ndl.go.jp/dcndl/terms/>
SELECT DISTINCT ?title_value ?transcription
WHERE {
?s dcterms:title [
dcndl:transcription ?transcription ;
rdf:value ?title_value ] .
}
LIMIT 100
確認のため、次の SPARQL クエリを実行します。](https://image.slidesharecdn.com/oraclesparql20160517slideshare-160517075327/85/Oracle-SPARQL-11-320.jpg)
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Oracle で SPARQL！
- 1. Copyright ? 2016 Oracle and/or its affiliates. All rights reserved. Oracle で SPARQL！ 日本オラクル株式会社 クラウド?テクノロジー事業統括 Cloud/Big Data/DISプロダクト本部 2016年5月17日更新
- 2. Copyright ? 2016 Oracle and/or its affiliates. All rights reserved. 以下の事項は、弊社の一般的な製品の方向性に関する概要を説明する ものです。また、情報提供を唯一の目的とするものであり、いかなる 契約にも組み込むことはできません。以下の事項は、マテリアルや コード、機能を提供することをコミットメント（確約）するものでは ないため、購買決定を行う際の判断材料になさらないで下さい。オラ クル製品に関して記載されている機能の開発、リリースおよび時期に ついては、弊社の裁量により決定されます。 Oracle と Java は、Oracle Corporation 及びその子会社、関連会社の米国及びその他の国に おける登録商標です。文中の社名、商品名等は各社の商標または登録商標である場合があります。 2
- 3. Copyright ? 2016 Oracle and/or its affiliates. All rights reserved. Oracle で SPARQL！ 3 ここでは、Oracle データベースを使用して、 既存の RDF データに対して SPARQL クエリを 実行するためのエンドポイントを構築する 方法を解説しています。 ? クラウド上にデータベースを作成 ? RDF オプションを有効化 ? 表領域とユーザーの作成 ? エンドポイントの構築 ? RDF データのアップロード ? SPARQL クエリの実行
- 4. Copyright ? 2016 Oracle and/or its affiliates. All rights reserved. 4 セットアップ
- 5. Copyright ? 2016 Oracle and/or its affiliates. All rights reserved. データベースの作成 5 Oracle Database Cloud Service（DBCS）で データベースを起動します。 ? High Performance Edition を選択 ? 詳細設定はデフォルトの値を使用 ? TCP ポート 3030 を開放します。 後の手順にて、以下の情報が必要となります。 ? DBCS の Identity Domain ? サービスの Public IP アドレスとホスト名 ? プラガブル?データベース（PDB）の SID（デフォルトは pdb1） nslookup コマンドなどを用いて IP アドレスから oraclecloud.com で終わるホスト名を確認します。
- 6. Copyright ? 2016 Oracle and/or its affiliates. All rights reserved. RDF オプションを有効化 6 $ sqlplus / as sysdba SQL> ALTER SESSION SET CONTAINER=pdb1; プラガブル?データベースにログインします。 SQL> @?/md/admin/catsem.sql SQL> SELECT value FROM mdsys.rdf_parameter; VALUE ------------------------- INSTALLED INSTALLED INSTALLED 12.1.0.2.0 RDF オプションを有効化するスクリプトを実行し、 インストールされたことを確認します。
- 7. Copyright ? 2016 Oracle and/or its affiliates. All rights reserved. 表領域とユーザーの作成 7 SQL> CREATE BIGFILE TABLESPACE rdftbs DATAFILE '/u02/app/oracle/oradata/ORCL/PDB1/rdftbs01.dbf' SIZE 5G; プラガブル?データベース上に RDF 格納用の表領域を作成します。 SQL> EXECUTE SEM_APIS.CREATE_SEM_NETWORK('rdftbs'); 上で作成した表領域を RDF 格納領域として設定します。 SQL> CREATE USER rdfuser IDENTIFIED BY rdfuser DEFAULT TABLESPACE rdftbs TEMPORARY TABLESPACE temp; SQL> GRANT connect, resource, unlimited tablespace TO rdfuser; ユーザーを作成します。
- 8. Copyright ? 2016 Oracle and/or its affiliates. All rights reserved. エンドポイントの構築 8 Oracle Support for Apache Jena and Fuseki を こちら から入手し、 クラウド上にアップロードしておきます。 $ unzip oracle_support_..._4.3.zip -d rdf $ chmod +w ~/rdf/fuseki/config-oracle.ttl $ vi ~/rdf/fuseki/config-oracle.ttl oracle:jdbc ... (SERVICE_NAME=pdb1.<identity_domain>.oraclecloud.internal)))"; 解凍して、設定ファイルを編集します。 $ cd ~/rdf/fuseki $ ./fuseki-server --config config-oracle.ttl --port 3030 エンドポイントを起動します。 $ scp oracle_support_..._4.3.zip oracle@<ip_address>:
- 9. Copyright ? 2016 Oracle and/or its affiliates. All rights reserved. 9 SPARQL 実行！
- 10. Copyright ? 2016 Oracle and/or its affiliates. All rights reserved. RDF データのアップロード（青空文庫のデータ） 10 公共の RDF データを取得します。 青空文庫 LOD のサイトの こちら から青空文庫に関する RDF データを ダウンロードすることができます。 エンドポイントにアクセスします。 http://<host_name>:3030/ 「Control Panel」でファイルを選択 してアップロードします。
- 11. Copyright ? 2016 Oracle and/or its affiliates. All rights reserved. SPARQL クエリの実行（青空文庫のデータ） 11 PREFIX rdf:<http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#> PREFIX dcterms:<http://purl.org/dc/terms/> PREFIX dcndl:<http://ndl.go.jp/dcndl/terms/> SELECT DISTINCT ?title_value ?transcription WHERE { ?s dcterms:title [ dcndl:transcription ?transcription ; rdf:value ?title_value ] . } LIMIT 100 確認のため、次の SPARQL クエリを実行します。
- 12. Copyright ? 2016 Oracle and/or its affiliates. All rights reserved. RDF データのアップロード（ChEMBL のデータ） 12 公共の RDF データを取得します。 ChEMBL のサイトの こちら から細胞株に関する RDF データを ダウンロードすることができます。 エンドポイントにアクセスします。 http://<host_name>:3030/ 「Control Panel」でファイルを選択 してアップロードします。
- 13. Copyright ? 2016 Oracle and/or its affiliates. All rights reserved. SPARQL クエリの実行（ChEMBL のデータ） 13 PREFIX chembl: <http://rdf.ebi.ac.uk/terms/chembl#> SELECT (?o AS ?Organism) (STR(COUNT(?s)) AS ?Count) WHERE {?s chembl:organismName ?o} GROUP BY ?o ORDER BY DESC(COUNT(?s)) 確認のため、次の SPARQL クエリを実行します。 -------------------------------------- | organism | count | ====================================== | "Homo sapiens" | "1058" | | "Mus musculus" | "139" | | "Rattus norvegicus" | "46" | | "Cricetulus griseus" | "22" | | "Chlorocebus aethiops" | "5" | | "Sus scrofa" | "4" | | "Canis lupus familiaris" | "4" |
- 14. Copyright ? 2016 Oracle and/or its affiliates. All rights reserved.