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RからPGXを実行！
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Rのデータフレーム型になれば可視化もおてのもの
#データフレームに列を追加、次数中心性の値が大きい順にソートし30件を抽出
>df$name <- row.names(df)
>df <- head(df[order(-df$INDEGREE),],n=30)
#棒グラフを表示
> par(mai = c(2, 0.68, 0.1, 0.35))
> barplot(df$INDEGREE,las=2,names.arg=df$name,cex.names=0.8)](https://image.slidesharecdn.com/rpgx-161222013937/85/R-pgx-12-320.jpg)
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- 1. Copyright ? 2016 Oracle and/or its affiliates. All rights reserved. R で PGX を使う 日本オラクル株式会社 武井美緒 2016年12月20日
- 2. Copyright ? 2016 Oracle and/or its affiliates. All rights reserved. 以下の事項は、弊社の一般的な製品の方向性に関する概要を説明するものです。 また、情報提供を唯一の目的とするものであり、いかなる契約にも組み込むこと はできません。以下の事項は、マテリアルやコード、機能を提供することをコ ミットメント（確約）するものではないため、購買決定を行う際の判断材料にな さらないで下さい。オラクル製品に関して記載されている機能の開発、リリース および時期については、弊社の裁量により決定されます。 Oracle と Java は、Oracle Corporation 及びその子会社、関連会社の米国及びその他の国に おける登録商標です。文中の社名、商品名等は各社の商標または登録商標である場合があります。 2
- 3. Copyright ? 2016 Oracle and/or its affiliates. All rights reserved. 自己紹介 3 名前：武井 美緒（たけい みお） 所属：日本オラクル株式会社 クラウド?テクノロジーコンサルティング事業本部 担当：Analytics関連製品担当 （Oracle R Enterprise,Oracle Data Miner…） 機械学習についてのトレーニングやデータ分析の技術支援を実施
- 4. Copyright ? 2016 Oracle and/or its affiliates. All rights reserved. R で PGX を使う 4 PGX release 2.3.0（現在は2.2.1）ではRからPGXを実行できます！ 利用のために必要なもの ■PGX：PGX release 2.3.0 ■R：ORE(Oracle R Enterprise) ■Rパッケージ： -OAAgraph -rJava（Third-Party Packages）
- 5. Copyright ? 2016 Oracle and/or its affiliates. All rights reserved. 念のため???Rとは？ 5 ?統計とデータサイエンスにおいて広く利用されているオープンソースのプログラミング言語と その実行環境 ?ベクトルを主なデータ構造とし、最小限の労力で統計解析を可能にする ?豊富なデータセット集 ?活発なコミュニティによるサードパーティライブラリの充実 ?統計解析に必要な多数の高水準組み込み関数 ?視覚化に優れたグラフ機能
- 6. Copyright ? 2016 Oracle and/or its affiliates. All rights reserved. ?Oracle DatabaseのオプションであるAdvanced Analyticsのコンポーネントの1つ ?Oracle Databaseと統合するためのRパッケージおよびOracle Databaseの機能のセット ?RユーザはSQLを使用せずにOracle Databaseにアクセスすることができ、サーバ上の埋め込み Rエンジン上でRスクリプトを実行できるため、大規模データの統計解析にも対応できる。 ?データの移動を排除し、データベースサーバ上でデータの準備?モデルの構築?Rオブジェクト の保存/管理ができるため、クライアントPCのメモリ制約を回避できる。 Database Server R Engine Other R packages Oracle R Enterprise packages R Client Spawned R Engine Other R packages Oracle R Enterprise packages SQL 結果 結果 OREとは???？
- 7. Copyright ? 2016 Oracle and/or its affiliates. All rights reserved. RからPGXを実行！ 7 「はじめようPGX」で実行していたヒーローのグラフを使ってRからPGXを実行 してみる 今回は次数中心性をRから実行 抜粋： Oracle Labs 発！ Parallel Graph Analytics（PGX）
- 8. Copyright ? 2016 Oracle and/or its affiliates. All rights reserved. RからPGXを実行！ 8 さっそくやってみる① #必要なライブラリの読み込み >require(rJava) >require(OAAgraph) #PGXサーバーへ接続 >oaa.graphConnect(pgxBaseUrl = "http://192.168.56.102:7007") #ヒーローのグラフをロード（有効グラフとして読み込み※） >graph <- oaa.graph(jsonPath = "/home/oracle/work/pgx/pgx_data/hero- network.json") ※そのため「Oracle Labs 発！ Parallel Graph Analytics（PGX） 」の資料の結果と異なります
- 9. Copyright ? 2016 Oracle and/or its affiliates. All rights reserved. RからPGXを実行！ 9 さっそくやってみる② #前処理の実施 >graph <- oaa.simplify(graph, keepMultiEdges = FALSE, keepSelfEdges = FALSE, keepTrivialNodes = FALSE, createCopy = TRUE, name = NULL) #取り込んだグラフの確認 >print(graph) Graph Name: hero-network_sub-graph_1 Number of Nodes: 6426 Number of Edges: 224169 Persistent Graph: FALSE Node Properties: Edge Properties:
- 10. Copyright ? 2016 Oracle and/or its affiliates. All rights reserved. RからPGXを実行！ 10 さっそくやってみる③ #次数中心性のアルゴリズムの実行 > c1 <- degree(graph, name ="INDEGREE", mode="In") #次数中心性の結果をRで分析するための準備 > cursor <- oaa.cursor(graph, c("INDEGREE")) #Rのデータフレーム型としてデータを取得（全ノードのデータを取得） >df <- oaa.next(cursor,graph$num_nodes)
- 11. Copyright ? 2016 Oracle and/or its affiliates. All rights reserved. RからPGXを実行！ 11 さっそくやってみる④ #データの確認 >head(df) INDEGREE LITTLE, ABNER 15 BLACK PANTHER/T'CHAL 487 STEELE, SIMON/WOLFGA 9 RAVEN, SABBATH II/EL 8 IRON MAN IV/JAMES R. 326 IRON MAN/TONY STARK 1106
- 12. Copyright ? 2016 Oracle and/or its affiliates. All rights reserved. RからPGXを実行！ 12 Rのデータフレーム型になれば可視化もおてのもの #データフレームに列を追加、次数中心性の値が大きい順にソートし30件を抽出 >df$name <- row.names(df) >df <- head(df[order(-df$INDEGREE),],n=30) #棒グラフを表示 > par(mai = c(2, 0.68, 0.1, 0.35)) > barplot(df$INDEGREE,las=2,names.arg=df$name,cex.names=0.8)
- 13. Copyright ? 2016 Oracle and/or its affiliates. All rights reserved. RからPGXを実行！ 13 Rのデータフレーム型になれば可視化もおてのもの
- 14. Copyright ? 2016 Oracle and/or its affiliates. All rights reserved. おわりに 14 RからPGXを実行できます！ Rから実行することで、PGXで実施した結果を簡単に可視化、さらなる分析の実 施を一連の流れの中で実施できるためとても便利になります。
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