Ppt mikrosatelit
Download as PPTX, PDF1 like2,369 views
Dokumen ini menjelaskan tentang marka molekuler mikrosatelit, termasuk mekanisme kerjanya, manfaat, dan contoh penggunaannya. Mikrosatelit merupakan alat yang akurat untuk membedakan genotipe dan seleksi karakter tertentu karena bersifat kodominan dan polimorfik. Penggunaannya telah bermanfaat dalam berbagai studi genetik populasi tanaman dan hewan.
More Related Content
What's hot (20)
Similar to Ppt mikrosatelit (20)
Ppt mikrosatelit
- 1. MARKA MOLEKULER MIKROSATELIT OLEH: Desi Hayati Putri NIM. 8126173002 Bio A1_PPs_Unimed 2013
- 2. PENDAHULUAN  Marka molekuler merupakan alat yang baik bagi pemulia dan ahli genetik untuk menganalisis genom mahluk hidup.  Penggunaan marka molekuler utamanya untuk memonitor variasi susunan DNA di dalam dan pada sejumlah spesies serta merekayasa sumber baru variasi genetik dengan mengintroduksi karakter-karakter yang baik.
- 3. MEKANISME KERJA MARKA MOLEKULER MIKROSATELIT  Mikrosatelit yang juga sering disebut dengan SSR merupakan alat bantu yang sangat akurat untuk membedakan genotipe, evaluasi kemurnian benih, pemetaan, dan seleksi genotip untuk karakter yang diinginkan.  Mikrosatelit tergolong sebagai penanda molekuler yang sangat efektif.  Marka ini sangat berguna sebagai marka genetik karena bersifat kodominan.  SSR memiliki tingkat polimorfisme yang tinggi stabil secara somatik dan diwariskan secara Mendelian.
- 4. Adapun mekanisme kerja dengan menggunakan marka molekuler mikrosatelit (berdasarkan penelitian Matra (2010) tentang Analisis keragaman genetic manggis berdasarkan karakter fenotipe dan marka molekuler mikrosatelit pada empat sentra produksi di pulau Jawa) adalah sebagai berikut:  Melakukan ekstraksi DNA  Melakukan pemotongan DNA genom dan ligase adaptor.  Melakukan hibridisasi filter  Meligasi ke vektor dan transformasi  Melakukan skrining biru-putih dan koloni berfragmen mikrosatelit  Mengisolasi plasmid dan proses sequen  Mengkarakterisasi primer  Menganalisis lokus mikrosatelit
- 5. MANFAAT DAN KEGUNAAN MIKROSATELIT  Penggunaan mikrosatelit dalam studi-studi genetic telah banyak dilakukan untuk studi genetic populasi, ekologi, pemuliaan tanaman, aliran gen (gene flow), dan keragaman genetic intraspesies maupun interspesies.  Mikrosatelit umumnya dipakai pada tanaman diploid, sedangkan manggis merupakan tanaman allotetraploid. Penggunaan mikrosatelit pada tanaman allotetraploid telah berhasil membedakan populasi tanaman alfafa (Matra, 2010)
- 6.  Identifikasi alel pada populasi monyet ekor panjang di Alas Kedaton menggunakan lokus mikrosatelit D18S536 yang dikaji pada penelitian ini, teridentifikasi 5 jenis alel dengan frekuensi alel tertinggi (0,31) untuk alel 160, dan terendah (0,06) untuk alel 176 serta digolongkan polimorfik (Lumban Gaol dkk, 2013).
- 7. DAFTAR PUSTAKA Lumban Gaol, A. D., Suatha, I. K., dan Wandina, I. N. 2013. Struktur Genetika Populasi Monyet Ekor Panjang Di Alas Kedaton Menggunakan Marka Molekul Mikrosatelit D18S536. Jurnal Indonesia Medicus Veterinus 2(1): 32 – 42. Matra, D. D. 2010. Analisis Keragamangenetik Manggis Berdasarkan Karakter Fenotipe dan Marka Molekuler Mikrosatelit pada Empat Sentra produksi Di Pulau Jawa. Bogor: Departemen Agronomi dan Hortikultura, Fakultas Pertanian, Institut Pertanian Bogor. Moeljopawiro, S. 2010. Marka Mikrosatelit sebagai Alternatif Uji BUSS dalam Perlindungan Varietas Tanaman Padi. Bogor: Balai Besar Penelitian dan Pengembangan Bioteknologi dan Sumberdaya Genetik Pertanian.