![スクリプトをコマンドで実行する
Rをコマンドで実行するには
$ R --help
Usage: R [options] [< infile] [> outfile]
or: R CMD command [arguments]
Start R, a system for statistical computation and graphics, with the
specified options, or invoke an R tool via the 'R CMD' interface.
Options:
-h, --help Print short help message and exit
--version Print version info and exit
--encoding=ENC Specify encoding to be used for stdin
--encoding ENC
RHOME Print path to R home directory and exit
--save Do save workspace at the end of the session](https://image.slidesharecdn.com/3-130506232705-phpapp01/85/3-R-13-320.jpg)
![とにかく使ってみる
d<-read.csv("test.csv",col.names=c("Eng","Jap"))
s.eng<-d[order(d$Eng,na.last = TRUE, decreasing=TRUE),1]
png("test.png", bg="white", width=500, height=600)
str_main<-"Test"
str_main<-paste(str_main," ")
str_mtext<-paste("Total Value->", len_y)
hist(s.eng)
mtext(str_mtext)
# for option slave
if (dev.cur() == 1){
dev.off()
}
Rファイルサンプル](https://image.slidesharecdn.com/3-130506232705-phpapp01/85/3-R-14-320.jpg)
![とにかく使ってみる
一番シンプルに使ってみる。
? R --option < input.R > out.txt
$ R --save < r_test.R > out.txt
$ cat out.txt
R version 2.15.3 (2013-03-01) -- "Security Blanket"
Copyright (C) 2013 The R Foundation for Statistical Computing
ISBN 3-900051-07-0
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Rは、自由なソフトウェアであり、「完全に無保証」です。
…
> # CSV読み込み
> d<-read.csv("test.csv",col.names=c("Eng","Jap"))
>
> s.eng<-d[order(d$Eng,na.last = TRUE, decreasing=TRUE),1]](https://image.slidesharecdn.com/3-130506232705-phpapp01/85/3-R-16-320.jpg)
第3回関西ゼロから始める搁勉强会
- 2. Agenda ? 自己紹介 ? RはGUIで動かすことが多い ? 定期的に結果がほしくなる ? スクリプトをコマンドで実行する ? とにかく使ってみる ? どうしてもPythonを使いたいなら
- 3. Agenda ? 自己紹介 ? RはGUIで動かすことが多い ? 定期的に結果がほしくなる ? スクリプトをコマンドで実行する ? とにかく使ってみる ? どうしてもPythonを使いたいなら
- 4. 自己紹介 ? 名前 飯田 啓介 (twitter: menphis_feel) (facebookの方に主に出現) ? 会社 株式会社ブリリアントサービス ? 業務 データ解析、マイニング
- 5. Agenda ? 自己紹介 ? RはGUIで動かすことが多い ? 定期的に結果がほしくなる ? スクリプトをコマンドで実行する ? とにかく使ってみる ? どうしてもPythonを使いたいなら
- 6. RはGUIで動かすことが多い R StadioなどGUIを使うとき ? 解析方法をいろいろ検討するとき ? コードを組むとき ? デバッグするとき
- 8. Agenda ? 自己紹介 ? RはGUIで動かすことが多い ? 定期的に結果がほしくなる ? スクリプトをコマンドで実行する ? とにかく使ってみる ? どうしてもPythonを使いたいなら
- 10. 定期的に結果がほしくなる 手段はいろいろあるだろう。 ? シェルスクリプトを利用する。 ? Pythonなどのスクリプトを利用する。 ? Rをそのまま実行する。 開発環境に合わせて最適な手段を選択 すればいい。
- 11. 定期的に結果がほしくなる 手段はいろいろあるだろう。 ? シェルスクリプトを利用する。 ? Pythonなどのスクリプトを利用する。 ? RRをそのまま実行する。をそのまま実行する。 あえてRをそのまま実行してみよう
- 12. Agenda ? 自己紹介 ? RはGUIで動かすことが多い ? 定期的に結果がほしくなる ? スクリプトをコマンドで実行する ? とにかく使ってみる ? どうしてもPythonを使いたいなら
- 13. スクリプトをコマンドで実行する Rをコマンドで実行するには $ R --help Usage: R [options] [< infile] [> outfile] or: R CMD command [arguments] Start R, a system for statistical computation and graphics, with the specified options, or invoke an R tool via the 'R CMD' interface. Options: -h, --help Print short help message and exit --version Print version info and exit --encoding=ENC Specify encoding to be used for stdin --encoding ENC RHOME Print path to R home directory and exit --save Do save workspace at the end of the session
- 14. とにかく使ってみる d<-read.csv("test.csv",col.names=c("Eng","Jap")) s.eng<-d[order(d$Eng,na.last = TRUE, decreasing=TRUE),1] png("test.png", bg="white", width=500, height=600) str_main<-"Test" str_main<-paste(str_main," ") str_mtext<-paste("Total Value->", len_y) hist(s.eng) mtext(str_mtext) # for option slave if (dev.cur() == 1){ dev.off() } Rファイルサンプル
- 15. Agenda ? 自己紹介 ? RはGUIで動かすことが多い ? 定期的に結果がほしくなる ? スクリプトをコマンドで実行する ? とにかく使ってみる ? どうしてもPythonを使いたいなら
- 16. とにかく使ってみる 一番シンプルに使ってみる。 ? R --option < input.R > out.txt $ R --save < r_test.R > out.txt $ cat out.txt R version 2.15.3 (2013-03-01) -- "Security Blanket" Copyright (C) 2013 The R Foundation for Statistical Computing ISBN 3-900051-07-0 Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit) Rは、自由なソフトウェアであり、「完全に無保証」です。 … > # CSV読み込み > d<-read.csv("test.csv",col.names=c("Eng","Jap")) > > s.eng<-d[order(d$Eng,na.last = TRUE, decreasing=TRUE),1]
- 17. 引数を使う R --vanilla --args test.csv < r_test.R 読み込むファイル名を引数で指定する。 引数の取り込みコマンド：commandArgs 使い方例 args <- commandArgs(trailingOnly = T) > help(commandArgs) trailingOnly: logical. Should only arguments after ‘--args’ be returned?
- 18. Agenda ? 自己紹介 ? RはGUIで動かすことが多い ? 定期的に結果がほしくなる ? スクリプトをコマンドで実行する ? とにかく使ってみる ? どうしてもPythonを使いたいなら
- 19. どうしてもPythonを使いたいなら Pythonを使う理由 ? グラフはmatplotlibを使いたい ? Rだけでスクリプトを実行したくない ? やりかたがわからない ? Pythonが好きだから
- 20. PythonでRを読み込む さすがPython以下の２ステップで実行でき る。 import rpy2.robjects as robjects ret=robjects.r(""" source("r_test.R") """)