![6. Ligase
Terjadi pembentukan ikatan C-C, C-S, C-O dan C-N
Contoh Enzim : Acetone Carboxylase
Contoh Inhibitor : ( + ) - p [ 1 ( p text
butylpheny) ] 2 oxo 4 pyrro
Mekanisme reaksi : ATP + acetyl CoA + HCO3 - +
H+ = ADP + phosphate + malonyl -
CoA](https://image.slidesharecdn.com/enzimfix-170430053618/85/Enzim-Nadya-dan-Intan-21-320.jpg)
![Contoh Penghambatan Reaksi Enzimatis
Inhibitor enzim baik yang bersifat reversible atau irreversible
Contoh: Dapat digunakan untuk memperlambat laju kerusakan
makanan terutama pada makanan mentah. Makanan mentah dapat
rusak karena reaksi enzim dari mikroorganisme atau dari jaringan
makanan itu sendiri. Inhibitor enzim dapat menghambat kerja
enzim sehingga masa simpan makanan bertambah lama.[5]](https://image.slidesharecdn.com/enzimfix-170430053618/85/Enzim-Nadya-dan-Intan-52-320.jpg)
More Related Content
What's hot (20)
Similar to Enzim (Nadya dan Intan) (20)
More from pure chems (20)
Recently uploaded (8)
Enzim (Nadya dan Intan)
- 1. Enzim By : Nadya Priskanauli Intan Nurfitria Universitas Negeri Jakarta Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Prodi Kimia 2015
- 2. Pokok Bahasan Enzim Definisi B.Bagian- bagian Klasifikasi F.Karakteristik sisi aktif enzim Kerja Enzim Macam- Macam G.Faktor- faktor kerja enzim Pengaturan Aktivitas Enzim I.Peranan enzim
- 3. Dalam sistem biologi reaksi kimia selalu memerlukan katalis. Tanpa katalis sangat lama sehingga diperlukan Enzim yg berfungsi sebagai biokatalisator Definisi Enzim
- 5. Katalis yg paling efisien mampu mempercepat reaksi 1020 kali lbh cepat Enzim bersifat sangat spesifik, baik jenis reaksi maupun substratnya , Tripsin Trombin
- 6. Enzim tidak ikut bereaksi dgn substrat atau produknya Aktifitas dapat dikontrol sesuai dengan kebutuhan organisme itu sendiri Contoh : enzim yg mengkatalisis reaksi pertama pada suatu siklus biosintesis biasanya di hambat oleh produk akhirnya(feedback inhibition) beberapa enzim disintesis dlm btk tidak aktif. Dan akan diaktifkan oleh kondisi dan waktu yang sesuai (enzim allosterik) . prekursor yg tidak aktif disebut zymogen
- 7. Tiga sifat utama enzim : Kemampuan katalitiknya Spesifisitas Kemampuan untuk diatur (regulasi)
- 9. Holoenzim : mempunyai gugus bukan protein, termasuk golongan enzim mejemuk Apoenzim/ apoprotein : Haloenzim yang terdiri atas protein Gugus prostetik : kofaktor yang terikat kuat pada bagian protein /sukar terurai dalam larutan Koenzim : ko-faktor yang yang tahan panas yang berfungsi sebagai pembawa sementara atom spesifik atau gugus fungsionil Kofaktor suatu gugus bukan protein
- 11. Lanjutan Seperti halnya protein lain, enzim memiliki BM antara 12,000 1 juta kd Beberapa enzim tidak membutuhkan molekul kimiawi lain untuk aktifitasnya, beberapa membutuhkan kofaktor / koenzim Kofaktor ion-ion inorganik yg dibutuhkan enzim untuk melakukan fungsinya Koenzim molekul organik (komplek) yang dibutuhkan enziim untuk melakukan fungsinya
- 12. Koenzim atau kofaktor yang terikat sangat kuat bahkan terikat dengan ikatan kovalen dengan enzim gugus prostetik Enzim aktif lengkap dengan semua komponennya holoenzim Bagian yang terdiri dari protein saja pada suatu enzim Apoenzim / apoprotein Fungsi koenzim adalah sebagai karier sementara dari gugus fungsional yg berperan dalam reaksi ensimatis tersebut.
- 15. 1. Oksido reduktase 2. Transferase 3. Hidrolase 4. Liase 5. Isomerase 6. Ligase Klasifikasi Enzim
- 16. 1. Oksidoreduktase Terjadi pemindahan elektron Contoh enzim : Alcohol dehydrogenase Contoh inhibitor : 7,10 phenanthroline Mekanisme reaksi : a primary alcohol + NAD+ = an aldehyde + NADH + H+ Peran di dalam tubuh : untuk mengkatalisis pengambilan atom hydrogen dari suatu senyawa, baik dehidrogenase atau oksidase.
- 17. 2. Transferase Terjadi pemindahan gugus fungsional Contoh Enzim : Methionine synthase Contoh Inhibitor : ZL 031 Mekanisme reaksi : 5-methyltetrahydrofolate + L- homocysteine = tetrahydrofolate + L-methionine Peran di dalam tubuh : Enzyme yang mengkatalisis reaksi pemindahan suatu gugus dari suatu senyawa kepada senyawa lain.
- 18. 3. Hidrolase Terjadi reaksi hidrolisis(pemindahan gugus fungsional ke air) Contoh Enzim : Cellulase Contoh Inhibitor : 2,4-dinitrophenol Mekanisme reaksi : Celluohexaose + H2O = 2 cellotriose Peran di dalam tubuh : Enzim yang berperan sebagai katalis pada reaksi hidrolisis baik pemecahan ester glikosida dan peptide.
- 19. 4. Liase Terjadi pemindahan gugus ke ikatan ganda Contoh Enzim : Carbonate dehydratase Contoh Inhibitor : (2E) 4 methoxy 4 oxobut 2 enoic acid Mekanisme reaksi : H2CO3 = CO2 + H2O
- 20. 5. Isomerase Terjadi pemindahan gugus di dalam molekul menghasilkan isomer Contoh Enzim : DNA Topoisomerase Contoh Inhibitor : ( + ) iso corydine Mekanisme reaksi : ATP + independent breakage of single strand ed DNA, followed by passage and rejoining
- 21. 6. Ligase Terjadi pembentukan ikatan C-C, C-S, C-O dan C-N Contoh Enzim : Acetone Carboxylase Contoh Inhibitor : ( + ) - p [ 1 ( p text butylpheny) ] 2 oxo 4 pyrro Mekanisme reaksi : ATP + acetyl CoA + HCO3 - + H+ = ADP + phosphate + malonyl - CoA
- 22. 1. Berdasarkan tempat enzim bekerja, yaitu : Endoenzim (enzim intraseluler) : ialah suatu enzim yang kerjanya di dalam sel Eksoenzim (enzim ekstraseluler) : Eksoenzim ini kebalikan dari endoenzim yang kerjanya diluar sel. Macam-Macam Enzim
- 23. 2. Berdasarkan cara terbentuknya, yaitu : Enzim konstitutif : ialah salah satu jenis enzim yang jumlahnya dipengaruhi oleh sebuah kadar molekul awalnya (substrat). Contohnya yaitu enzim amilase yang terdapat pada suatu saliva.
- 24. Enzim adaptif : ialah salah satu jenis enzim yang pembentukannya distimulasi oleh adanya sebuah substrat. Contohnya enzim 硫-galaktosidase yang dihasilkan oleh suatu bakteri E.coli yang ditumbuhkan di dalam suatu medium yang mengandung laktosa
- 25. Karbohidrase ialah suatu enzim-enzim yang mengkatalisis sebuah pemecahan karbohidrat yang terdapat pada disaliva (air ludah) dan usus halus. Contoh: enzim selulose, amilase, pektinase, maltose, sukrose, laktose. (fungsi nya sudah dibahas diatas) Protease : ialah suatu enzim-enzim yang mengkatalisis pemecahan sebuah rantai protein didalam tubuh. Enzim protease ini terutama terdapat di organ lambung dan di usus halus. Contoh: enzim pepsin, renin, tripsin, enterokinase, peptidase, dan gelatinase. 3. Berdasarkan Proses yang di katalisis, yaitu :
- 26. Esterase salah satu jenis enzim ini ialah sebuah enzim yang mempunyai fungsi untuk mengkatalisis pemecahan rantai ester, terutama yang ditemukan di dalam sebuah asam nukleat dan juga lipid (lemak). Contoh dari enzim esterase yiatu enzim lipase, dan fosfatase.
- 27. 4. Pembagian Enzim berdasarkan lokasinya 1. Enzim plasma fungsional Terdapat sepanjang waktu dalam sirkulasi individu normal, substrat juga terdapat dalam sirkulasi dan melakukan fungsi fisiologis dalam darah. Contoh: Lipoprotein lipase, pseudokolinesterse, proenzim bekuan darah dan lisis bekuan darah umumnya disintesis dlm hati, konsentrasi dlm darah sama atau lebih tinggi dibandingkan dlm jaringan
- 28. 2. Enzim plasma non fungsional Tidak melakukan fungsi fisiologis dlm darah Substrat sering tdk ada dlm plasma Konsentrasi dlm darah individu normal berjutakali lebih rendah dibanding dlm jaringan Contoh amylase pancreas, lipase, alkali fosfatase empedu, dan asam fosfatase prostat
- 29. LOKASI ENZIM Dalam sel hati: Enzim-enzim glikolisis terletak dalam sitoplasma Enzim-enzim siklus asam sitrat terdapat dalam mitokondria Dalam sel pankreas, lambung dan saliva Isozim : enzim yg mengkatalisa rx yg sama tetapi sifat fisika dan kimia protein menunjukkan perbedaan yg bermakna
- 30. Kerja Enzim Reaksi tanpa enzim: Lambat Membutuhkan suhu yang tinggi Tekanan yang tinggi Reaksi enzimatis Enzim memberikan suatu lingkungan yg spesifik di dalam sisi aktifnya, sehingga reaksi secara energetik dapat lebih mudah terjadi
- 31. Perbedaan antara energi reaktan (fase awal) dgn energi produk (fase akhir) selisih energi bebas standar (G尊) Agar reaksi berjalan spontan, bagaimanakah nilai G尊 ?
- 32. Enzim mempercepat reaksi tetapi tidak mengubah keseimbangan reaksi atau G尊 Kesetimbangan reaksi antara Reaktan dan produk mencerminkan perbedaan energi bebas pada fase awal
- 33. Kecepatan reaksi tergantung energi aktifasi G尊 Suatu pasokan energi dibutuhkan untuk mengawali suatu reaksi Energi aktifasi untuk reaksi pada katalis dengan enzim lebih rendah dari reaksi tanpa ensim Glukosa + 6 O2 6 CO2 + 6 H2O G尊 = -2880 kJ/mol
- 34. Enzim penting untuk menurunkan energi aktifasi untuk memulai suatu reaksi Enzim mengikat substrat menciptakan jalan reaksi yg berbeda yg mempunyai fase transisi lebih rendah dibanding reaksi tanpa enzim Inti dari reaksi katalisis ikatan yg spesifik pada fase transisi
- 35. Substrat terikat interaksi nonkovalen E + S ES EP E + P Kekuatan enzim dlm mengkatalisis suatu reaksi yaitu kemampuan enzim membawa substrat bersama-sama pada orientasi yang tepat untuk terjadinya suatu reaksi Substrat terikat pada sisi aktif cekukan pada protein yg berisi asam amino yg penting untuk terjadinya suatu reaksi kimia
- 37. Merupakan bagian kecil dari enzim sisi aktif Merupakan suatu cekukan yang bersifat 3 dimensi. memberikan linkungan mikro yg sesuai utk terjadinya suatu reaksi kimia Substrat terikat pada sisi aktif dengan interaksi / ikatan yang lemah. Spesifitas enzim dipengaruhi oleh asam amino yg menyusun sisi aktif suatu enzim Karakteristik sisi aktif enzim
- 38. Gambar sisi aktif ensim dan asam amino yang terlibat
- 39. Sisi aktif mempunyai 2 bagian yg penting: o Bagian yang mengenal substrat dan kemudian mengikatnya o Bagian yang mengkatalisis reaksi, setelah substrat diikat oleh enzim Asam amino yang membentuk kedua bagian tersebut tidak harus berdekatan dalam urutan secara linear, tetapi dalam konformasi 3D mereka berdekatan
- 40. Teori untuk menjelaskan kerja enzim:
- 41. 1. Lock and Key analogy Enzim memiliki struktur sisi spesifik yang cocok dengan substrat. Mampu menerangkan spesifitas ensim tetapi tidak dapat menerangkan stabilitas fase transisi enzim Contohnya adalah Enzim katalase. Enzim ini banyak terdapat pada organel peroksisom dan berfungsi memecah peroksida (H2O2) yang bersifat toksik menjadi H2O dan O2.
- 43. 2. Induced Fit theory Mempertimbangkan fleksibilitas protein, sehingga pengikatan suatu substrat pada enzim menyebabkan sisi aktif mengubah konformasinya sehingga cocok dgn substratnya. dapat menerangkan fase transisi ES komplek Contoh: enzim amylase, pada substrate adalah amylum
- 45. 3. Current View Substrat terbentuk dengan berorientasi dan mendorong keluar masuk pada sisi aktif untuk memfasilitasi reaksi kimia, distorsi substrat menyerupai keadaan transisi untuk reaksi, yang merupakan geometri tegang substrat dalam langkah menengah antara reactans dan produk
- 47. pH setiap enzim mempunyai pH optimum untuk bekerja. contoh : pepsin pH 2, amylase pH 7.0 Temperatur setiap kenaikan suhu 10C (sampai 40C), kecepatan reaksi naik 2 x lipatnya dan reaksi terhambat dan berhenti pada 60C. Konsentrasi Substrat : Konsentrasi Substrat maka semakin banyak jumlah molekul substrat yang terlibat dalam aktivitas enzim. Faktor-faktor kerja enzim
- 48. Konsentrasi Enzim : konsentrasi enzim maka kecepatan reaksi akan semakin cepat pula Aktivator & Inhibitor Aktivator merupakan molekul yang membantu enzim agar mudah berikatan dengan substrat. Inhibitor adalah substansi yang memiliki kecenderungan untuk menghambat aktivitas enzim. Inhibitor enzim memiliki Tiga cara berbeda mengganggu fungsi enzim. Berdasarkan caranya, inhibitor dibagi menjadi 3 kategori: inhibitor kompetitif, inhibitor non-kompetitif, dan inhibitor un-kompetitif.
- 49. Hubungan ezim dengan factor-factor yang mempengaruhi kerja enzim
- 50. Hubungan kecepatan reaksi dengan konsentrasi substrat
- 51. Penghambatan Reaksi Enzimatis Kerja enzim dapat dihambat secara reversible atau irreversible Irreversible pembentukan atau pemecahan ikatan kovalen dalam enzim Reversible suatu senyawa dapat terikat dan kemudian dpt lepas kembali Reversible inhibitor ini dapat dibagi : o competitive o non-competitive o un-competitive
- 52. Contoh Penghambatan Reaksi Enzimatis Inhibitor enzim baik yang bersifat reversible atau irreversible Contoh: Dapat digunakan untuk memperlambat laju kerusakan makanan terutama pada makanan mentah. Makanan mentah dapat rusak karena reaksi enzim dari mikroorganisme atau dari jaringan makanan itu sendiri. Inhibitor enzim dapat menghambat kerja enzim sehingga masa simpan makanan bertambah lama.[5]
- 53. Contoh Inhibitor irreversibel Inhibitor ini berikatan dengan sisi aktif enzim secara kuat sehingga tidak dapat terlepas. Enzim menjadi tidak aktif dan tidak dapat kembali seperti semula (irreversible). Contohnya, diisopropilfluorofosfat yang menghambat kerja asetilkolin-esterase.
- 54. Penghambatan competitive inhibitor bersaing dengan substrat untuk terikat pada sisi aktif Biasanya inhibitor berupa senyawa yang menyerupai substratnya, & mengikat enzim membentuk komplek EI karna terikat secara reversible ketika ditambah substrat maka penghambatan berkurang
- 55. Inhibitor kompetitif Contohnya malonat dan oksalosuksinat, yang bersaing dengan substrat untuk berikatan dengan enzim suksinat dehidrogenase, yaitu enzim yang bekerja pada substrat oseli suksinat.
- 56. Penghambatan non-competitive inhibitor terikat pada sisi lain dari enzim (bukan sisi aktif) jadi tidak memblok pembentukan enzim-substrat komplek Enzim menjadi tidak aktif ketika inhibitor terikat walau enzim mengikat substrat Inhibitor mengurangi konsentrasi enzim yg aktif, sehingga mempengaruhi Vmax nya
- 57. Contoh: Antibiotik penisilin menghambat kerja enzim penyusun dinding sel bakteri. Inhibitor ini bersifat reversible tetapi tidak dapat dihilangkan dengan menambahkan konsentrasi substrat.
- 58. Penghambatan un-competitive Terikat pada sisi selain sisi aktif enzim Berbeda dengan non-competitive inhibitor ini hanya terikat pd ES komplek Sehingga tidak terikat pd enzim bebas Vmax berubah, dan Km juga berubah
- 61. 1. Pengaturan enzim Alosterik 2. Modifikasi Kovalen 3. Proteolisis Terbatas Pengaturan Aktivitas Enzim
- 62. 1. Enzim allosterik Enzim allosterik mengalami perubahan konformasi sebagai respon terhadap pengikatan modulator efektor Allosterik enzim biasanya lebih komplek dari non allosterik enzim, memiliki sub unit lebih dari satu
- 63. Memiliki satu atau lebih sisi allosterik / regulator untuk mengikat modulator. Seperti halnya substrat, setiap regulator memiliki sisi pengikatan yang berbeda Untuk enzim homotropik sisi aktif dan sisi regulator sama
- 64. 2. Modifikasi Kovalen Merupakan penempelan satu gugus terhadap enzim Modifikasi kovalen reversibel dari enzim yang diatur. Contoh enzim glikogen fosforilase, suatu enzim yang mengkatalis pemecahan glikogen
- 65. 3. Proteolia Terbatas Enzim ini diaktifkan oleh pembelahan rantai polipeptida Disintesis dalam bentuk tidak aktifdan diaktifkan oleh pembuangan fragmen kecil dari amino terminal secara proteolitik Contoh Enzim pencernaan tripsin, dan kimi tripsin
- 67. 1. Penyelidikan reaksi-reaksi metabolik dan pengaturannya 2. Sebagai katalisator dalam industri yg mensintesis hormon/antibiotik 3. Membantu dalam menegakkan diagnosa karena kadar enzim pada keadaan patologik tertentu dapat mengalami perubahan yang nyata dalam darah ataupun jaringan, penyakit genetik (endonuklease retriksi) 4. Dalam pengolahan pangan, pertanian, peternakan dan pada aktivitas sehari-hari dirumah Peranan enzim